基于質譜的定量蛋白質組學分析：技術原理與應用檢測技術服務詳情介紹

在后基因組時代，定量dànbáizhì組學已成為解析生命系統(tǒng)復雜性、理解疾病機制和發(fā)現生物標志物的核心工具。特別是以質譜為基礎的定量dànbáizhì組學，因其靈敏度高、通量大、定量準確等優(yōu)勢，廣泛應用于基礎研究與生物醫(yī)藥開發(fā)之中。本文將系統(tǒng)梳理質譜定量dànbáizhì組學的核心技術原理、主流策略及其應用場景。

一、什么是定量dànbáizhì組學？

dànbáizhì組學是指在給定生物體系中對dànbáizhì的全面研究，定量dànbáizhì組學則進一步聚焦于dànbáizhì表達水平的動態(tài)變化，通過比較不同條件下dànbáizhì豐度的變化，揭示潛在的生物學機制。在技術層面，質譜（Mass Spectrometry, MS）已成為dànbáizhì組學分析的中樞工具，能夠在高通量的基礎上實現dànbáizhì的鑒定與定量。

二、質譜定量dànbáizhì組學的主流策略

1、基于標記的方法（Label-based）

標記定量方法通過在樣本處理或肽段水平引入穩(wěn)定同位素標簽，實現樣本間dànbáizhì豐度的比較。

（1）化學標記（如TMT/iTRAQ）

• 使用同位素標簽在多達16個樣本中實現多重定量。

• 定量精度高，適合大規(guī)模樣本比較。

• 需結合高分辨率質譜平臺。

（2）代謝標記（如SILAC）

• 通過細胞培養(yǎng)引入“輕/重"氨基酸，實現在細胞水平的內源性標記。

• 適合哺乳動物細胞模型，定量準確性好。

2、基于無標記的方法（Label-free）

無標記定量策略主要依賴于MS信號強度或譜圖計數，具有操作簡便、成本低的優(yōu)點。

• 適合大樣本量、復雜體系的研究場景。

• 可擴展性強，但對樣品處理和儀器穩(wěn)定性要求較高。

3、靶向定量方法（如PRM/MRM）

與全蛋白組分析不同，靶向定量關注特定dànbáizhì/肽段的jīngzhǔn檢測，常用于驗證發(fā)現階段的候選分子。

• 靈敏度高，重復性強。

• 適用于臨床前研究與生物標志物驗證。

三、樣本類型與數據處理要點

※ 多樣的樣本類型支持

基于質譜的定量dànbáizhì組學適用于多種生物樣本，包括：

• 細胞與組織提取物

• 血清/血漿等體液樣本

• 臨床病理切片或FFPE組織

不同樣本類型對前處理策略、蛋白提取效率及酶解條件的優(yōu)化提出挑戰(zhàn)，需根據研究目標定制實驗流程。

※ 數據處理與生物信息分析

原始質譜數據需通過專用算法進行處理，包括：

• 肽段匹配與dànbáizhì推斷

• 相對或juéduì定量計算

• 差異蛋白篩選與富集分析

進一步可結合通路富集、PPI網絡構建、轉錄組聯合分析等手段，實現多層次數據挖掘。

四、應用場景

1、疾病機制解析

• 比較疾病組與對照組的dànbáizhì表達譜，挖掘與病理過程相關的調控通路。

• 聯合代謝組學、轉錄組學，實現系統(tǒng)層面理解。

2、生物標志物發(fā)現

• 識別與疾病診斷/預后相關的特異性dànbáizhì。

• 為臨床轉化研究提供候選靶標。

3、藥物靶點驗證

• 通過靶向定量評估藥物對特定信號通路的干預效果。

• 支持新藥研發(fā)與jīngzhǔn醫(yī)學。

4、發(fā)育與環(huán)境響應研究

• 探究不同發(fā)育階段、處理條件下蛋白表達動態(tài)變化。

• 有助于基礎生物學機制的深入理解。

基于質譜的定量dànbáizhì組學分析已成為現代生命科學研究的重要支柱。通過合理選擇定量策略、嚴控實驗流程并輔以zhuānyè的數據分析，研究者可以從海量蛋白數據中提取具有生物學意義的信息。百泰派克生物科技基于優(yōu)良的質譜平臺，融合標準化樣本處理流程與成熟的生物信息分析策略，為客戶提供高通量、高覆蓋、高重復性的定量蛋白組分析服務。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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