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dànbáizhì修飾組學(xué)(Proteomics of post-translational modifications, PTM proteomics)是研究dànbáizhì后轉(zhuǎn)錄修飾(Post-translational modifications, PTMs)的系統(tǒng)性分析方法。PTMs是細(xì)胞中的重要生物化學(xué)事件,它們在幾乎所有的生物過程中都起到關(guān)鍵作用,包括信號傳導(dǎo)、細(xì)胞周期調(diào)控、基因表達(dá)和細(xì)胞死亡等。
dànbáizhì修飾組學(xué)的主要目標(biāo)是:
1.確定dànbáizhì的所有修飾位點。
2.量化特定修飾的豐度變化。
3.解析不同修飾之間的相互作用和協(xié)同效應(yīng)。
以下是dànbáizhì修飾組學(xué)中使用的關(guān)鍵技術(shù)和方法:
1.質(zhì)譜分析:
這是dànbáizhì修飾組學(xué)中zuì常用和zuì有力的工具。它允許研究者確定dànbáizhì的修飾位點、類型以及修飾的豐度。
2.富集技術(shù):
由于某些修飾(如磷酸化、乙酰化)可能存在于低豐度中,因此需要使用特定的方法(如抗體富集、親和純化)來富集含有這些修飾的蛋白片段或肽段。
3.標(biāo)記量化:
例如同位素標(biāo)記(如SILAC、iTRAQ、TMT)允許在不同的生物樣本或處理條件下定量比較蛋白修飾的豐度。
4.生物信息學(xué)工具:
用于數(shù)據(jù)分析和解釋,幫助研究者確定潛在的生物學(xué)意義和與其他生物過程的關(guān)聯(lián)。
5.功能驗證:
使用分子生物學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)技術(shù)驗證質(zhì)譜數(shù)據(jù),例如利用突變體或RNA干擾技術(shù)來探索特定修飾位點的功能。
dànbáizhì修飾組學(xué)為我們提供了寶貴的洞察,有助于深入了解細(xì)胞的信號傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)、調(diào)控機(jī)制和生物學(xué)功能。隨著技術(shù)的進(jìn)步,我們可以預(yù)期未來將有更多關(guān)于dànbáizhì修飾在健康和疾病中作用的深入了解。
圖1
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