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49次多肽序列測(cè)定是dànbáizhì組學(xué)研究中的一個(gè)核心環(huán)節(jié),它涉及到對(duì)dànbáizhì或多肽的序列進(jìn)行jīngquè的鑒定。MS-MS,也就是串聯(lián)質(zhì)譜(Tandem Mass Spectrometry),是實(shí)現(xiàn)這一目的的一種強(qiáng)有力的技術(shù)。本文將介紹多肽序列測(cè)定的基本原理、MS-MS技術(shù)的工作機(jī)制以及它在生物醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用。
一、基本原理
dànbáizhì或多肽的序列測(cè)定基于對(duì)其組成氨基酸的識(shí)別。每種dànbáizhì是由20種氨基酸以不同順序組合而成的長(zhǎng)鏈分子,這種順序稱為dànbáizhì的序列。測(cè)定一個(gè)dànbáizhì的序列,實(shí)質(zhì)上就是要確定這些氨基酸的排列順序。
二、MS-MS技術(shù)
串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)通過(guò)兩級(jí)質(zhì)譜分析來(lái)實(shí)現(xiàn)多肽序列的測(cè)定。首先,在dìyī級(jí)質(zhì)譜(MS1)中,混合的dànbáizhì樣品被電離成帶電的分子(離子),然后通過(guò)質(zhì)荷比(m/z)進(jìn)行分離。接著,選定特定的離子進(jìn)行第二級(jí)質(zhì)譜(MS2)分析。在MS2中,這些選定的離子被進(jìn)一步分解成更小的片段離子,通過(guò)分析這些片段離子的質(zhì)荷比,可以推斷出原始多肽的氨基酸序列。
三、步驟流程
樣本準(zhǔn)備dànbáizhì提?。簭纳飿颖局刑崛ànbáizhì,并通過(guò)酶(如yídànbáiméi)切割成多肽。肽段純化:使用色譜技術(shù)(如液相色譜)純化切割后的多肽,以減少樣品復(fù)雜性并提高后續(xù)分析的靈敏度。
MS/MS分析dìyī級(jí)質(zhì)譜(MS1):多肽樣品被引入質(zhì)譜儀,并被電離(通常使用電噴霧電離,ESI,或基質(zhì)輔助激光解吸/電離,MALDI)。電離后的多肽離子在dìyī級(jí)質(zhì)譜中被測(cè)量其質(zhì)荷比(m/z)。離子選擇與碎片化:特定的多肽離子根據(jù)其m/z值被選中并送入碰撞室,在那里它們被碎片化。這個(gè)過(guò)程產(chǎn)生一系列代表原始多肽序列不同部分的碎片離子。第二級(jí)質(zhì)譜(MS2):這些碎片離子的m/z值在第二級(jí)質(zhì)譜中被測(cè)量,生成一個(gè)譜圖,即MS/MS譜圖。
圖1. 蛋白/多肽串聯(lián)質(zhì)譜測(cè)序流程
四、序列測(cè)定譜圖分析
MS/MS譜圖被分析以鑒定碎片離子的類(lèi)型和順序,這些信息被用來(lái)推斷原始多肽的氨基酸序列。數(shù)據(jù)庫(kù)搜索:使用特定的軟件(如Mascot,SEQUEST,或MaxQuant)將MS/MS數(shù)據(jù)與已知dànbáizhì數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行匹配,以確定多肽的序列。
MS-MS技術(shù)是一種強(qiáng)大的工具,對(duì)于理解生物系統(tǒng)的分子機(jī)制至關(guān)重要。通過(guò)jīngquè地鑒定dànbáizhì和多肽的序列,它幫助科學(xué)家揭示了許多生命過(guò)程的秘密,推動(dòng)了生物醫(yī)學(xué)研究的發(fā)展。隨著技術(shù)的進(jìn)步和應(yīng)用的拓展,MS-MS將繼續(xù)在dànbáizhì組學(xué)及其相關(guān)領(lǐng)域中發(fā)揮重要作用。
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