一文看懂多肽組學(xué)在癌癥檢測(cè)中的潛力檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

多肽組學(xué)（peptidomics）作為質(zhì)譜（mass spectrometry）驅(qū)動(dòng)的生命科學(xué)分支，能全面分析體內(nèi)天然存在的短肽或多肽片段。這些片段往往攜帶疾病特異性信息，是癌癥早期診斷和療效監(jiān)測(cè)的新興生物標(biāo)志物來(lái)源。本文將從技術(shù)基礎(chǔ)、應(yīng)用前沿和發(fā)展趨勢(shì)三方面系統(tǒng)解析多肽組學(xué)在癌癥檢測(cè)中的潛力，并軟性植入 百泰派克生物科技 在該領(lǐng)域的優(yōu)勢(shì)能力。

一、什么是多肽組學(xué)？

1、技術(shù)定位

。多肽組學(xué)研究的是未經(jīng)酶切的內(nèi)源短肽（約8–30?aa），與dànbáizhì組學(xué)（proteomics）相比，無(wú)需yídànbáiméi消化，能直接捕捉生理/病理生成的肽段

2、分離與檢測(cè)方法

。多肽組學(xué)通常采用液相色譜（LC）或基質(zhì)輔助雷射解吸/電離（MALDI-TOF-MS）進(jìn)行肽段分離和高分辨質(zhì)譜分析

3、數(shù)據(jù)處理與識(shí)別

。利用 MS/MS 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)接，配合生物信息學(xué)算法（如 DDA/DIA、深度學(xué)習(xí)），實(shí)現(xiàn)多肽序列的定性定量鑒定

二、多肽組學(xué)在癌癥檢測(cè)中的主要應(yīng)用

1、早期癌癥篩查

（1）非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）： 血清多肽指紋圖譜有助于區(qū)分早期 NSCLC 與良性病變，以及健康對(duì)照。

（2）口腔癌預(yù)測(cè)： 通過(guò)口腔唾液或血清多肽組學(xué)發(fā)現(xiàn)與預(yù)后相關(guān)的候選多肽。

2、huàliáo療效與耐藥監(jiān)測(cè)

肺鱗癌人群： 利用 MALDI-TOF-MS 分析huàliáo敏感組與耐藥組的血清多肽差異，建立療效預(yù)測(cè)模型。

3、miǎnyìzhìliáo靶點(diǎn)探索

（1）免疫多肽組學(xué)（Immunopeptidomics）： 分析腫瘤細(xì)胞通過(guò) MHC-I/II 遞呈的突變多肽（neoantigens），揭示腫瘤“暗物質(zhì)”，為個(gè)性化腫瘤疫苗與 T?細(xì)胞療法提供靶點(diǎn)。

（2）生物信息聯(lián)動(dòng)： 結(jié)合 WES、RNA-seq、in silico MHC 配對(duì)和 MS 數(shù)據(jù)，jīngzhǔn篩選具免疫原性的突變多肽。

4、抗腫瘤功能肽發(fā)現(xiàn)

。通過(guò)噬菌體展示、AI 篩選等策略，從毒液肽、天然生理肽庫(kù)中篩選具有腫瘤靶向或細(xì)胞毒性的功能多肽

三、優(yōu)勢(shì)與挑戰(zhàn)

1、相比傳統(tǒng)生物標(biāo)志物的優(yōu)勢(shì)

（1）高靈敏性：可檢測(cè)低豐度肽段，反應(yīng)早期病理變化。

（2）源于體內(nèi)生成：無(wú)需酶切處理，保留了生理狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)和修飾。

（3）標(biāo)志物通用性強(qiáng)：多肽指紋可適用于不同樣本來(lái)源，如血液、唾液、尿液。

2、當(dāng)前挑戰(zhàn)

（1）樣本處理標(biāo)準(zhǔn)化不足，易影響肽譜穩(wěn)定性和可重復(fù)性。

（2）高豐度肽遮蔽低豐度肽信號(hào)，需要豐富策略解決。

（3）臨床驗(yàn)證不夠深入，多數(shù)研究仍處于候選驗(yàn)證階段，缺少臨床試驗(yàn)支撐。

（4）免疫肽識(shí)別算法仍需改進(jìn)，MS 數(shù)據(jù)量大，需更準(zhǔn)、更快的深度學(xué)習(xí)模型。

四、多肽組學(xué)典型流程

多肽組學(xué)的實(shí)驗(yàn)流程需高度jīngzhǔn與標(biāo)準(zhǔn)化，以確保分析結(jié)果的重復(fù)性和生物學(xué)意義。以下是從樣本采集到生物標(biāo)志物驗(yàn)證的標(biāo)準(zhǔn)操作流程：

1、樣本采集與預(yù)處理

（1）樣本類型：多肽可來(lái)源于多種生物基質(zhì)，如血清、血漿、尿液、腦脊液（CSF）、唾液及組織勻漿。

（2）關(guān)鍵考量：避免蛋白降解、肽段失活和預(yù)分析變化是核心，例如使用蛋白酶抑制劑、防凍劑，并快速凍存于 ?80?°C。

（3）標(biāo)準(zhǔn)化策略：統(tǒng)一采樣時(shí)間點(diǎn)、處理溫度與離心條件，以減少組間變異性。

2、多肽提取與富集

（1）蛋白沉淀去除：使用三lǜyǐsuān（TCA）、乙腈/甲醇沉淀或熱處理快速去除高豐度大分子蛋白，釋放內(nèi)源多肽。

（2）固相萃?。⊿PE）：C18 或強(qiáng)陽(yáng)離子交換（SCX）柱常用于富集多肽，去除鹽類、小分子干擾物。

（3）高通量策略：自動(dòng)化 SPE 平臺(tái)和磁珠富集技術(shù)提升處理效率并減少批間差異。

3、分離分析

（1）液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用（LC-MS/MS）：以納升級(jí) LC（nanoLC）結(jié)合高分辨率質(zhì)譜（如 Orbitrap、TOF）進(jìn)行肽段分離與檢測(cè)。

（2）MALDI-TOF-MS 分析：用于快速指紋分析與初篩，適合大樣本量、多組別研究。

（3）離子遷移譜（IMS）等新興技術(shù)：進(jìn)一步提升肽段結(jié)構(gòu)識(shí)別能力，分辨異構(gòu)肽。

4、數(shù)據(jù)采集與定性定量

（1）數(shù)據(jù)采集模式：

• DDA（Data-Dependent Acquisition）：常用于探索性研究，捕捉信號(hào)zuì強(qiáng)的肽段進(jìn)行 MS/MS。

• DIA（Data-Independent Acquisition）：全譜段掃描，適合大樣本、穩(wěn)定性分析。

（2）定量方式：

• 標(biāo)簽法（TMT/iTRAQ）用于多組比較。

• 無(wú)標(biāo)記法（Label-Free）適合大規(guī)模隊(duì)列，簡(jiǎn)化操作。

• 靶向法（MRM/PRM）用于生物標(biāo)志物驗(yàn)證。

5、生物信息學(xué)分析

（1）多肽識(shí)別：使用數(shù)據(jù)庫(kù)搜索引擎（如 Mascot、PEAKS、MaxQuant）結(jié)合深度學(xué)習(xí)模型輔助序列匹配。

（2）差異分析：結(jié)合統(tǒng)計(jì)學(xué)方法（如 t 檢驗(yàn)、ANOVA）和多變量分析（如 PCA、PLS-DA），挖掘具有顯著差異的候選肽段。

（3）功能注釋與通路富集：對(duì)差異多肽進(jìn)行 KEGG/GO 富集分析，揭示其潛在生物學(xué)功能。

（4）肽段溯源：將鑒定肽段追溯到上游蛋白及剪切機(jī)制，探索病理狀態(tài)下的蛋白水解調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

6、生物標(biāo)志物驗(yàn)證與臨床轉(zhuǎn)化

（1）靶向定量驗(yàn)證：通過(guò) MRM/PRM 質(zhì)譜平臺(tái)，驗(yàn)證候選肽在獨(dú)立隊(duì)列中的表達(dá)趨勢(shì)。

（2）免疫學(xué)方法融合：若開發(fā)抗體成功，可結(jié)合 ELISA、Western Blot 等手段進(jìn)行臨床可轉(zhuǎn)化驗(yàn)證。

（3）模型構(gòu)建：通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)（如 SVM、XGBoost）整合多個(gè)標(biāo)志物，建立預(yù)測(cè)模型并評(píng)估其敏感性、特異性（AUC、ROC 分析）。

百泰派克生物科技在“多肽組學(xué)+癌癥檢測(cè)”領(lǐng)域，具備以下優(yōu)勢(shì)：

1、gāoduān質(zhì)譜平臺(tái)：采用 Orbitrap Fusion Lumos、Q?EQ96 等高分辨儀器，具備高通量電離能力。

2、zhuānyè技術(shù)團(tuán)隊(duì)：SCI 出版及臨床項(xiàng)目背景團(tuán)隊(duì)，熟練 LC-MS/MS、MALDI 和免疫多肽組學(xué)方法。

3、標(biāo)準(zhǔn)化流程與質(zhì)量控制：從采樣、提取、檢測(cè)到數(shù)據(jù)管理，均可根據(jù)客戶需求設(shè)計(jì)并滿足 GLP/GCLP 標(biāo)準(zhǔn)。

4、定制開發(fā)能力強(qiáng)：支持多肽指紋庫(kù)構(gòu)建、突變肽篩選與功能性驗(yàn)證。

5、賦能客戶落地轉(zhuǎn)化：結(jié)合 MRM/PRM/ELISA 平臺(tái)，助力體外診斷試劑和臨床驗(yàn)證的快速推進(jìn)。

多肽組學(xué)是癌癥檢測(cè)中的科研前沿，具備高靈敏、結(jié)構(gòu)保真、疾病特異性強(qiáng)的優(yōu)勢(shì)，正逐步走向臨床應(yīng)用。隨著免疫多肽組學(xué)與人工智能技術(shù)進(jìn)步，多肽生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證將更高效、更jīngzhǔn。百泰派克生物科技憑借*質(zhì)譜平臺(tái)和zhuānyè研發(fā)能力，可為客戶提供“一站式”多肽組學(xué)服務(wù)，助力腫瘤標(biāo)志物研究與體外診斷開發(fā)。如果您關(guān)注多肽組學(xué)在癌癥檢測(cè)的落地應(yīng)用，歡迎聯(lián)系我們，共同探索jīngzhǔn醫(yī)學(xué)的未來(lái)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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