ABPP技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)全解析，適合哪些研究？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

基于功能蛋白zhìzǔxué的ABPP技術(shù)（Activity-Based Protein Profiling，活性基dànbáizhì譜分析），可用于在復(fù)雜的生物樣本中檢測(cè)、富集和鑒定具有催化活性的酶蛋白。本文將從ABPP技術(shù)的原理出發(fā)，系統(tǒng)解析其優(yōu)勢(shì)與局限，并探討其在生命科學(xué)中的典型應(yīng)用場(chǎng)景。

一、ABPP技術(shù)原理簡(jiǎn)介

ABPP利用活性探針（activity-based probes, ABPs）選擇性標(biāo)記具有催化活性的酶蛋白。這些探針通常由三部分組成：

1、反應(yīng)基團(tuán)（warhead）：與靶酶活性位點(diǎn)共價(jià)結(jié)合；

2、連接臂（linker）：調(diào)控空間構(gòu)型與穩(wěn)定性；

3、報(bào)告基團(tuán)（reporter tag）：用于富集或檢測(cè)，如熒光基團(tuán)、shēngwùsù等。

通過(guò)質(zhì)譜分析（通常結(jié)合LC-MS/MS）識(shí)別標(biāo)記蛋白，實(shí)現(xiàn)對(duì)“功能性蛋白組”的特異性檢測(cè)。

二、ABPP技術(shù)的主要優(yōu)勢(shì)

1、功能導(dǎo)向，不依賴蛋白豐度

ABPP區(qū)別于傳統(tǒng)dànbáizhì組技術(shù)，其篩選依據(jù)是酶的催化活性，而非表達(dá)量，能直接反映生理或病理狀態(tài)下的功能蛋白變化。

2、適用于復(fù)雜樣本與原位分析

ABPP可在細(xì)胞裂解液、組織勻漿，甚至活細(xì)胞或動(dòng)物模型中原位應(yīng)用，實(shí)現(xiàn)對(duì)內(nèi)源酶活性的原態(tài)檢測(cè)。

3、高選擇性與可拓展性

通過(guò)定制反應(yīng)基團(tuán)，可針對(duì)不同酶家族（如sīānsuān水解酶、半胱天冬酶、金屬蛋白酶等）開(kāi)發(fā)專屬探針，具有良好的靶向性與拓展性。

4、兼容多種定量策略

ABPP可結(jié)合SILAC、TMT、label-free等多種定量方法，拓展其在動(dòng)態(tài)調(diào)控研究和藥物篩選中的應(yīng)用深度。

三、ABPP技術(shù)的局限

1、靶標(biāo)局限性

目前ABPP主要聚焦于可共價(jià)修飾的酶類，對(duì)非催化蛋白、結(jié)構(gòu)蛋白或轉(zhuǎn)錄因子不適用，存在一定的靶標(biāo)范圍限制。

2、探針設(shè)計(jì)難度高

ABPs需具備高選擇性、細(xì)胞通透性與低毒性，且合成復(fù)雜、優(yōu)化周期長(zhǎng)，對(duì)化學(xué)設(shè)計(jì)與合成能力要求較高。

3、假陽(yáng)性與非特異結(jié)合

共價(jià)標(biāo)記可能引發(fā)非特異性結(jié)合，尤其在復(fù)雜樣本中，增加背景噪音，需要通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)和對(duì)照組嚴(yán)謹(jǐn)驗(yàn)證。

4、技術(shù)平臺(tái)依賴性強(qiáng)

ABPP分析依賴高靈敏度的質(zhì)譜平臺(tái)和成熟的數(shù)據(jù)處理流程，實(shí)驗(yàn)成本較高，且對(duì)操作人員的技術(shù)要求較高。

四、ABPP適用的研究場(chǎng)景

1、藥物作用機(jī)制研究

ABPP可用于識(shí)別藥物作用靶點(diǎn)，尤其在共價(jià)抑制劑篩選中具有dútè優(yōu)勢(shì)。通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)標(biāo)記實(shí)驗(yàn)，可揭示小分子是否與靶酶活性位點(diǎn)結(jié)合。

2、疾病相關(guān)酶活譜分析

通過(guò)比較健康與疾病狀態(tài)下的酶活性圖譜，挖掘潛在的生物標(biāo)志物或致病機(jī)制，如腫瘤、神經(jīng)退行性疾病、感染等領(lǐng)域。

3、代謝通路動(dòng)態(tài)研究

ABPP結(jié)合時(shí)間梯度實(shí)驗(yàn)，可動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)特定酶的激活或失活過(guò)程，揭示信號(hào)通路調(diào)控節(jié)點(diǎn)。

4、環(huán)境毒理與外源物質(zhì)作用研究

ABPP可評(píng)估環(huán)境毒素、農(nóng)藥或化學(xué)污染物對(duì)酶系統(tǒng)的影響，拓展至生態(tài)毒理學(xué)與暴露組學(xué)研究。

百泰派克生物科技提供基于ABPP技術(shù)的定制化蛋白活性譜繪制服務(wù)，涵蓋：

1、高選擇性活性探針篩選與優(yōu)化

2、多類型樣本處理與前處理策略

3、基于Orbitrap的高分辨率質(zhì)譜檢測(cè)

4、結(jié)合TMT/SILAC的定量分析策略

5、嚴(yán)格的數(shù)據(jù)挖掘與生物信息學(xué)注釋

ABPP作為功能蛋白組學(xué)的重要分支技術(shù)，其對(duì)酶活性狀態(tài)的jīngzhǔn解析能力，使其在藥物發(fā)現(xiàn)與生物醫(yī)學(xué)研究中展現(xiàn)出dútè價(jià)值。隨著新型探針的開(kāi)發(fā)與質(zhì)譜技術(shù)的持續(xù)升級(jí)，ABPP的應(yīng)用潛力仍將不斷擴(kuò)展。如您希望深入了解ABPP技術(shù)的應(yīng)用或有相關(guān)實(shí)驗(yàn)需求，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，我們期待與您共同探索蛋白功能的未知世界。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

ABPP技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)全解析，適合哪些研究？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹