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單細(xì)胞分選要考慮的問題及優(yōu)勢介紹2022/10/18
單細(xì)胞分選通過細(xì)胞識別、細(xì)胞挑取和細(xì)胞轉(zhuǎn)移、跟蹤實(shí)時(shí)分析四個(gè)步驟可以實(shí)現(xiàn)對懸浮體系中任何單一類型細(xì)胞或稀有細(xì)胞(如循環(huán)腫瘤細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞、干細(xì)胞以及血液、骨髓中相關(guān)細(xì)胞等)的抓取分離、分析,細(xì)胞可以轉(zhuǎn)移到PCR管等后續(xù)實(shí)驗(yàn)裝置。利用流式細(xì)胞分選技術(shù)進(jìn)行的單細(xì)胞分選,具有精度高、通量大、分選參數(shù)多,成本相對低等優(yōu)點(diǎn),通過流式分選出足夠多的符合要求的單細(xì)胞進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)并沒有那么容易。一、下面三方面是要考慮的問題:1、活性細(xì)胞活性狀態(tài)對后續(xù)實(shí)驗(yàn)而言很重要,就拿轉(zhuǎn)錄組分析為例,無論是RNA-Seq還是高
單細(xì)胞分離分的好,才能做得好!2022/10/13
單細(xì)胞測序的難點(diǎn)在于如何把不同類型的組織解離成單細(xì)胞懸液。目前,主要的單細(xì)胞分離方法有口吸法、顯微操作法、流式細(xì)胞法、微流控。顯微操作法是一種能夠直接觀察到單細(xì)胞分離的方法。這一方法能夠準(zhǔn)確控制單個(gè)細(xì)胞的吸取與釋放,但是對實(shí)驗(yàn)操作的要求較高,不利于規(guī)?;僮?,F(xiàn)ACS則能夠大規(guī)模獲得單細(xì)胞樣本,該方法是利用流式細(xì)胞儀,借助于細(xì)胞表面標(biāo)記分選出特定群體的細(xì)胞或單個(gè)細(xì)胞。雖然這一方法需要專門的設(shè)備,且細(xì)胞的消化和分選過程會(huì)對細(xì)胞狀態(tài)產(chǎn)生一定的影響,但是該方法的效率和準(zhǔn)確率較高,標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)一,有利于不同實(shí)
單細(xì)胞DNA甲基化的發(fā)展歷程及研究目的2022/09/21
由于技術(shù)進(jìn)步,目前單細(xì)胞DNA測序現(xiàn)在可以作為常規(guī)實(shí)驗(yàn),并且研究人員可通過該技術(shù)詳細(xì)描述細(xì)胞群體中的異質(zhì)性。細(xì)胞間差異有可能對應(yīng)表現(xiàn)在表觀遺傳標(biāo)記的差異,進(jìn)而與基因表達(dá)有關(guān)。因此,具有測量單細(xì)胞水平上的全基因組DNAme的能力將有助于深入了解轉(zhuǎn)錄調(diào)控和細(xì)胞異質(zhì)性,以及完善對DNAme模式在細(xì)胞分裂過程中建立并遺傳了特定的基因座的理解。基于亞硫酸氫鹽的全基因組甲基化測序是*用于DNAme研究的金標(biāo)準(zhǔn),達(dá)到單堿基分辨率。亞硫酸氫鹽處理后使未甲基化的胞嘧啶殘基脫氨基變成尿嘧啶,發(fā)生了甲基化的胞嘧啶受到
單細(xì)胞鋪板時(shí)如何鋪出合格的板子?2022/09/09
單細(xì)胞鋪板是將一個(gè)孔加入少量無血清培養(yǎng)基,晃動(dòng)浸潤整個(gè)孔底,然后用移液槍吸至第二孔,同樣方法浸潤孔底,其它孔依此類推,這樣整個(gè)孔底都是濕潤的,細(xì)胞懸液會(huì)平鋪在整個(gè)孔底。單細(xì)胞鋪板的好壞決定了后續(xù)實(shí)驗(yàn)的成敗,這個(gè)實(shí)驗(yàn)看似簡單,其實(shí)也不是那么好做,其中關(guān)鍵是要鋪得均勻鋪得平整,其中的操作蘊(yùn)含著豐富技巧。要鋪出一個(gè)好的板子,必須要做到一下幾點(diǎn):1、單細(xì)胞重懸貼壁細(xì)胞培養(yǎng)完成后需要將細(xì)胞消化收集,并獲得單細(xì)胞懸液,但這時(shí)候即便消化下來也會(huì)連在一起了。這時(shí)我們需要注意:消化細(xì)胞需要選擇適用的消化液、適當(dāng)?shù)?
單細(xì)胞分離的方法和技術(shù)亮點(diǎn)介紹2022/09/09
單細(xì)胞分離提取系統(tǒng)用于各種類型的單細(xì)胞分離培養(yǎng)、純化、檢測;獲得單克隆細(xì)胞;用于單細(xì)胞基因擴(kuò)增,用于單細(xì)胞測序等。一、單細(xì)胞的分離方法:1.機(jī)械法首先輕輕地研碎葉片組織,然后再通過過濾以及離心純化細(xì)胞。相比于酶解法,機(jī)械法對細(xì)胞進(jìn)行分離有如下2個(gè)特點(diǎn),分別是質(zhì)壁分離的情況不會(huì)發(fā)生與不會(huì)有酶對細(xì)胞造成傷害。2.酶解法利用果膠酶對植物的葉片進(jìn)行處理,使得細(xì)胞間的中膠層發(fā)生降解,從而使具有代謝活性的細(xì)胞被分離出來。用來分離細(xì)胞的果膠酶不但可以使中膠層發(fā)生降解,還可以使細(xì)胞壁軟化。所以在使用酶解法對細(xì)胞
這樣進(jìn)行單細(xì)胞分離實(shí)際操作更有效2022/09/08
目前,單細(xì)胞多組學(xué)分析正在如火如荼地進(jìn)行著,在各大雜志上發(fā)表了一些重磅的研究成果。也許你也很想嘗試一下,但是在那之前,你需要把單細(xì)胞分離出來。理想狀態(tài)下的單細(xì)胞分離速度快、效率高,而實(shí)際操作可能效率低、時(shí)間長。從異質(zhì)細(xì)胞群體中分離單細(xì)胞主要有人工分離、熒光激活細(xì)胞分選和微流控技術(shù)三種方法。當(dāng)然,除了成熟的方法外,還不斷涌現(xiàn)出新的精確度和特異度分離的新方法。如果您想要的細(xì)胞在懸浮狀態(tài)中含量相對較高,流式分選是您理想的選擇。如果樣本為實(shí)體組織,則可將膠原蛋白及其它細(xì)胞外蛋白質(zhì)分解。但是酶消化對細(xì)胞的
單細(xì)胞分離不理想,您需要了解新的技術(shù)和技巧2022/08/18
如今,單細(xì)胞多組學(xué)分析正在如火如荼地開展,各大雜志上不斷有重磅的新成果發(fā)表。也許您也躍躍欲試,不過在此之前,您需要分離出單細(xì)胞。您理想中的單細(xì)胞分離是不是快速而高效的,而現(xiàn)實(shí)中的過程也許是低效而漫長的。在此,我們將介紹一些新的細(xì)胞分離技術(shù)并分享一些操作時(shí)的小技巧。細(xì)胞分離的挑戰(zhàn):準(zhǔn)備分離單細(xì)胞的研究人員必須克服許多挑戰(zhàn)。他們希望獲得純正的目標(biāo)細(xì)胞群,且細(xì)胞的各種特征都保持不變。如何才算不錯(cuò)的分離方法?它應(yīng)當(dāng)保持細(xì)胞活力,提供足夠數(shù)量的細(xì)胞,并且可根據(jù)未來的需求而擴(kuò)展。它還能夠防止細(xì)胞聚集,并且操
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組對于疾病研究的應(yīng)用說明2022/08/09
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是近年來生物學(xué)領(lǐng)域比較火的技術(shù)之一,憑借著其分辨率能夠精準(zhǔn)的剖析樣本細(xì)胞組成信息。隨著細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的發(fā)展,在多個(gè)應(yīng)用領(lǐng)域都有巨大的應(yīng)用潛力??傮w來說,目前細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用主要有:腫瘤具有很強(qiáng)的異質(zhì)性,這種異質(zhì)性對于腫瘤的疾病進(jìn)展和藥物療效都有至關(guān)重要的影響。了解腫瘤微環(huán)境及免疫微環(huán)境的組成有助于我們對腫瘤更清晰的了解,從而發(fā)現(xiàn)潛在的治療靶點(diǎn)。目前,單細(xì)胞測序已廣泛應(yīng)用于腫瘤微環(huán)境的研究中。該研究繪制了從非萎縮性胃炎-萎縮性胃炎-腸上皮化生-早期胃癌患者胃黏膜的單細(xì)胞圖譜,研
淺析單細(xì)胞測序的作用與意義所在2022/07/20
單細(xì)胞測序是指獲取單個(gè)細(xì)胞遺傳信息的測序技術(shù),即對單個(gè)細(xì)胞水平上,對基因組或轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行提取擴(kuò)增和高通量測序分析。該技術(shù)能夠揭示單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),包括結(jié)構(gòu)變異、拷貝數(shù)變異、RNA表達(dá)水平等數(shù)據(jù),使不同細(xì)胞類型得以精確區(qū)分,并有助于科學(xué)家在但細(xì)胞水平進(jìn)行分子機(jī)制的研究。為什么要做單細(xì)胞測序?對于多細(xì)胞生物來說,在細(xì)胞的分裂和分化過程中,必然會(huì)逐漸產(chǎn)生或大或小的差異,即遺傳信息的異質(zhì)性。例如,同一腫瘤組織中的不同細(xì)胞內(nèi)涵不同基因組和轉(zhuǎn)錄組等遺傳信息,就臨床利用上而言,這種差異或能影響某
單細(xì)胞RNA測序的技術(shù)流程及應(yīng)用2022/07/11
單細(xì)胞RNA測序是指在單細(xì)胞水平上對轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序的方法,是目前生物學(xué)研究領(lǐng)域的一項(xiàng)熱點(diǎn)技術(shù)。與普通高通量RNA測序相比,單細(xì)胞RNA測序可以分辨單個(gè)細(xì)胞間的生物學(xué)差異,識別出易被忽視的罕見細(xì)胞群體和細(xì)胞亞群。測序技術(shù)與其他RNA測序的基本原理相似,流程包括細(xì)胞制備、文庫構(gòu)建、測序和數(shù)據(jù)分析。其中單細(xì)胞制備和單細(xì)胞文庫構(gòu)建是重要的環(huán)節(jié),決定了數(shù)據(jù)質(zhì)量、測序通量、精確度、靈敏度和可重復(fù)性。單細(xì)胞的分離制備技術(shù)目前主要有流式細(xì)胞分選術(shù)、免疫磁珠細(xì)胞分選技術(shù)、顯微操作法、微流控技術(shù)等。單細(xì)胞RNA測序
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的基本概念,一起來了解下 2022/06/23
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組就是某一時(shí)刻單個(gè)細(xì)胞內(nèi)所有mRNA總表達(dá)量,其表達(dá)量反映該細(xì)胞的總體特征。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的出現(xiàn)使得我們可以把研究的精度從組織多細(xì)胞層面精確到單個(gè)細(xì)胞領(lǐng)域,可以單獨(dú)研究某個(gè)細(xì)胞或者某群細(xì)胞具體的特征,特別是對于細(xì)胞發(fā)育、腫瘤微環(huán)境、單細(xì)胞圖譜繪制方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。普通轉(zhuǎn)錄組的思路也可以應(yīng)用到單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組。普通轉(zhuǎn)錄組相當(dāng)于把一群細(xì)胞或一個(gè)器官混合到一起去提取RNA,獲得的是每個(gè)細(xì)胞中RNA表達(dá)量的平均值。單細(xì)胞是把每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)分出來去提取RNA,然后建庫測序,獲得是是單個(gè)細(xì)胞的表達(dá)值
一文帶你詳細(xì)了解一下單細(xì)胞分析2022/06/20
單細(xì)胞分析能夠準(zhǔn)確的提供出細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)及細(xì)胞內(nèi)生化反應(yīng)的準(zhǔn)確信息,能夠反應(yīng)出細(xì)胞的功能與化學(xué)組分間的特定關(guān)系,以及某些細(xì)胞在生命體內(nèi)的特殊作用。在對單細(xì)胞分析研究中,主要涉及單細(xì)胞進(jìn)樣、溶膜、衍生及檢測技術(shù)。單細(xì)胞分析中如何取樣是該方法研究的關(guān)鍵之一。單個(gè)全細(xì)胞進(jìn)樣可以用電遷移或流體動(dòng)力學(xué)進(jìn)樣。由于以上方法需要對毛細(xì)管的進(jìn)樣端口進(jìn)樣腐蝕,并且需要一些精密微操縱系統(tǒng),所以操作比較復(fù)雜。細(xì)胞在進(jìn)入毛細(xì)管通道后,一般需要對細(xì)胞進(jìn)行溶膜以便進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)的分析分離檢測。通常使用表面活性劑或者用低滲溶液達(dá)到
單克隆分離的原理及正確操作方法2022/05/27
單克隆分離是由單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分裂、增殖,形成具有相同遺傳性狀的細(xì)胞群體。由于來源于同一個(gè)祖先細(xì)胞,擴(kuò)增形成的細(xì)胞群還具有十分相近的形態(tài)特征和基本一致的生理、生化特性。是建立穩(wěn)定細(xì)胞系的重要環(huán)節(jié),因而在現(xiàn)代生物技術(shù)和醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域中應(yīng)用廣泛。構(gòu)建穩(wěn)定細(xì)胞系的常用方法有質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法和病毒侵染法,兩種方法都需要借助抗生素篩選,通過單細(xì)胞克隆分離最終獲得表型穩(wěn)定、遺傳特性一致的細(xì)胞群。質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法是通過轉(zhuǎn)染試劑將質(zhì)粒dna導(dǎo)入細(xì)胞,其中極少部分dna會(huì)整合到基因組,通過單細(xì)胞克隆分離和抗生素篩選,獲得表達(dá)效率高
單細(xì)胞鋪板的特點(diǎn)及工作原理如下所示2022/05/24
單細(xì)胞鋪板采用最新的微流體技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)快速,高效,準(zhǔn)確的細(xì)胞鋪板工作。并且分離過程輕柔,不會(huì)影響細(xì)胞的后續(xù)生長。能廣泛應(yīng)用于單抗開發(fā)中的CLD環(huán)節(jié),以及單細(xì)胞測序等。特點(diǎn):快速---一塊96孔板1min。高效---單細(xì)胞鋪板比例近90%。活性---無損分選,高復(fù)蘇比例。無菌---一次性無菌芯片,可保證無菌分選,并且避免樣本交叉污染。原理如下:將細(xì)胞通過一次性的芯片上端加樣孔,注入到芯片腔體中。單細(xì)胞流在微流控通道中流過激光檢測區(qū)域,機(jī)器能對細(xì)胞進(jìn)行識別,去除掉細(xì)胞碎片,死細(xì)胞以及狀態(tài)較差的細(xì)胞,
單細(xì)胞分離法能提供實(shí)時(shí)結(jié)果與分析2022/05/17
單細(xì)胞分離采用微流體技術(shù)分選細(xì)胞,對細(xì)胞無傷害,大于90%細(xì)胞培養(yǎng)活性率;同時(shí)具有高解析攝像,細(xì)胞克隆挑選可追溯的功能,并符合藥物監(jiān)管要求;采用微流體技術(shù),僅80μl珍貴樣本,即可獲取單細(xì)胞分選;5~10分鐘完成96孔板分選,同時(shí)適用384孔板分選;細(xì)胞分選用單細(xì)胞自動(dòng)化挑選分注系統(tǒng)。細(xì)胞分離以數(shù)字方式記錄單細(xì)胞和匯合度的證據(jù),以供審查和提交至監(jiān)管機(jī)構(gòu),在多個(gè)時(shí)間點(diǎn)以非侵入的方式對細(xì)胞進(jìn)行成像,以監(jiān)測克隆形成,使用高分辨率白光成像進(jìn)行篩選,提供實(shí)時(shí)結(jié)果與實(shí)時(shí)分析,自動(dòng)化和集成準(zhǔn)備。從異質(zhì)性的細(xì)胞
單細(xì)胞挑選滿足不同類型細(xì)胞的挑選需求2022/05/17
單細(xì)胞挑選系統(tǒng)主要用于識別、挑取和轉(zhuǎn)移懸液中單細(xì)胞或單一類型細(xì)胞,借助高清晰度的CCD成像,操作者可以直觀地看到目的細(xì)胞,隨后通過操控軟件控制毛細(xì)管高效地完成對懸浮細(xì)胞或半貼壁細(xì)胞的挑取和轉(zhuǎn)移,比如挑選CTC、干細(xì)胞等。整個(gè)過程可視化、操作簡單、挑取準(zhǔn)確,對各種類型的單細(xì)胞挑選游刃有余。單細(xì)胞挑選是全自動(dòng)檢測分析、無損傷分離、精確轉(zhuǎn)移細(xì)胞克隆、單細(xì)胞或組織的操作系統(tǒng);需分選的細(xì)胞可被分離到50nl-12ul帶有培養(yǎng)基或基底膜的獨(dú)立環(huán)境。細(xì)胞克隆或組織片段可以被金屬刮取毛細(xì)管通過刮取移動(dòng)模式從細(xì)胞
單克隆分離的方法及具體介紹2022/05/06
單克隆分離是建立穩(wěn)定細(xì)胞系的重要環(huán)節(jié),因而在現(xiàn)代生物技術(shù)和醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域中應(yīng)用廣泛,構(gòu)建穩(wěn)定細(xì)胞系的常用方法有質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法和病毒侵染法,兩種方法都需要借助抗生素篩選,通過單細(xì)胞克隆分離獲得穩(wěn)定、遺傳特性一致的細(xì)胞群。通過單細(xì)胞克隆分離和抗生素篩選,獲得表達(dá)效率高、整合穩(wěn)定的細(xì)胞群,最終構(gòu)建成穩(wěn)定細(xì)胞系;而病毒侵染法則是通過將攜帶目的片段的病毒,常用的如慢病毒,轉(zhuǎn)導(dǎo)入細(xì)胞,再通過單細(xì)胞克隆和抗生素篩選,獲得穩(wěn)定細(xì)胞系。目前常規(guī)的單克隆分離技術(shù)主要包括有限稀釋法、克隆環(huán)法和顯微操作法。有限稀釋法是通過將
淺談單克隆篩選的特點(diǎn)和篩選方法2022/05/06
單克隆篩選是根據(jù)細(xì)胞所具有的特性將單個(gè)細(xì)胞從混合的細(xì)胞樣品中分離出來的?種技術(shù),是抗體制備細(xì)胞株優(yōu)化、穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株構(gòu)建、藥物靶點(diǎn)篩選等應(yīng)?中重要的?環(huán),能夠更好地為不同鄰域科學(xué)研究和藥物研發(fā)提供支持。一、特點(diǎn):1、通用性篩選:適用于多種細(xì)胞,無需攜帶抗性熒光標(biāo)簽。2、單列線性模式:適用于高價(jià)值細(xì)胞。3、提供克隆性證據(jù):可為每個(gè)克隆提供克隆形成圖像。4-溫和的微流控技術(shù):更高存活率,更低損失率。二、單克隆篩選的方法1、有限稀釋法:克隆/亞克?。悍蛛x單個(gè)細(xì)胞置入多孔培養(yǎng)板的每個(gè)孔中培養(yǎng)。然后,用ELI
單細(xì)胞基因組主要具備以下這些優(yōu)勢2022/05/05
單細(xì)胞基因組是在單細(xì)胞水平對全基因組進(jìn)行擴(kuò)增與測序的一項(xiàng)新技術(shù)。其原理是將分離的單個(gè)細(xì)胞的微量全基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,獲得高覆蓋率的完整的基因組后進(jìn)行高通量測序用于揭示細(xì)胞群體差異和細(xì)胞進(jìn)化關(guān)系。從方法學(xué)角度來看,獲得高覆蓋率高保真性的全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物是準(zhǔn)確全面的測序結(jié)果的保障。多重置換擴(kuò)增(multipledisplacementamplification,MDA)利用隨機(jī)引物和等溫?cái)U(kuò)增可以獲得高保真的DNA大片段,但該方法的主要缺陷在于非平衡的基因組覆蓋率、擴(kuò)增偏倚、嵌合序列及非特異擴(kuò)增等。
淺析單克隆分離的三種分離技術(shù)2022/04/25
單克隆分離技術(shù)主要包括有限稀釋法、克隆環(huán)法和顯微操作法。有限稀釋法是通過將細(xì)胞懸液連續(xù)梯度稀釋,使最終在細(xì)胞培養(yǎng)板的一個(gè)孔中僅有1個(gè)細(xì)胞,再經(jīng)過兩周左右時(shí)間增殖,形成細(xì)胞群,再經(jīng)過驗(yàn)證獲得穩(wěn)定克??;克隆環(huán)法是通過在10-15cm的細(xì)胞培養(yǎng)皿中,將細(xì)胞接種低密度,使分散的單個(gè)細(xì)胞各自增殖成細(xì)胞群,用克隆環(huán)方式與周圍的細(xì)胞隔離開,通過胰酶消化,轉(zhuǎn)到新的孔板中繼續(xù)培養(yǎng)擴(kuò)增,并檢測驗(yàn)證而獲得穩(wěn)定克??;顯微操作法是借助顯微鏡,在放大的視野下挑取單細(xì)胞,再轉(zhuǎn)至培養(yǎng)孔中,逐漸擴(kuò)增獲得單克隆。這三種方法有各自一
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