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干貨 | 收藏夾吃灰系列之克隆典型案例分析

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2024年12月06日 09:40  

聽說沒有,聽說沒有,最近有一款克隆試劑聽上去挺火的呀!

你說的是翌圣一步法快速克?。–at#10923ES)?

對對對,就是它,克隆陽性率高,上至7個連接片段,下至6 μL連接體系,你可以想不到,但它都可以做到!

這么牛嘛,有具體的實驗案例嗎?


 

小翌
 

那就讓我們一起來看看大家是怎么成功獲得陽性克隆的吧~

 

 

 

單片段典型實驗案例分析

 

來自同濟大學(xué)A課題組

 

//
 

實驗要點

 
  • 實驗思路設(shè)計完整。

  • 載體線性化全,載體、片段均純化。

  • 載體:片段的摩爾比1:2。

  • 連接反應(yīng)時間50℃,10 min。(小翌家的10923ES單片段連接也可快至5 min,歡迎嘗試~

  • 實驗嚴(yán)謹(jǐn)且驗證充分,菌P、測序均驗證。

 

//
 

實驗亮點

 

在10 μL小體系下,通過10923ES克隆試劑盒成功構(gòu)建了單基因過表達(dá)載體,陽性率可達(dá)100%。

 

 

多片段典型實驗案例分析

 

來自同濟大學(xué)B課題組

 

//
 

實驗要點

 
  • 實驗思路設(shè)計完整。

  • 載體線性化全,載體、片段均純化。

  • 載體/片段摩爾比為該實驗者經(jīng)驗累計,由1:2調(diào)整為1:1和1:3。小翌依舊推薦載體:片段的摩爾比1:2。

  • 連接反應(yīng)時間50℃,30 min。(此為4片段連接標(biāo)準(zhǔn)時間,小翌嚴(yán)選推薦!

  • 實驗嚴(yán)謹(jǐn)且驗證充分,菌P、測序均驗證。

 

//
 

實驗亮點

 

4片段+載體連接成功,克隆數(shù)優(yōu)于競品,陽性率100%。片段中包含高GC序列、3×flag標(biāo)簽,片段投入量小于50ng,連接難度較大。

 

看了以上兩位同學(xué)的實驗結(jié)果,你是否也心癢難耐,想要一展身手!

 

要想獲得成功的實驗結(jié)果,嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶嶒炘O(shè)計思路和適合的實驗方法是重中之重。小翌強烈推薦Hieff Clone®系列克隆試劑盒(Cat#10923ES),為您的實驗保駕護航!那么實驗記錄表也是要的,既可以幫助大家記錄實驗細(xì)節(jié),也能通過記錄表復(fù)盤實驗思路,事半功倍!小翌根據(jù)自己做實驗的經(jīng)驗總結(jié)了實驗記錄本格式,放于文章最后,小伙伴們可自行取用~

 

載體大小

     bp

片段大小1、2、3...

     bp

載體酶切位點

(如果為反向PCR,可不填)

片段含同源臂的引物序列


可通過翌圣無縫克隆引物設(shè)計軟件    進行引物設(shè)計

線性化載體純化方式


片段純化方式


載體濃度

     ng/μL

片段濃度

     ng/μL

載體投入體積

     μL

片段投入體積

     μL

推薦翌圣—支持中心—生物計算器—克隆連接投入量計算板塊,輸入片段數(shù)、濃度、大小,即可獲得投入量: 

反應(yīng)條件

溫度     ℃、時間       min

感受態(tài)轉(zhuǎn)化步驟

如:小翌的快速感受態(tài)細(xì)胞

1、提前15 min將LB平板放到37℃培養(yǎng)基中預(yù)熱。

2、將F-DH5α感受態(tài)細(xì)胞(DH5α Fast Chemically Competent Cell,Cat#11803ES)從-80℃拿出迅速插入冰上,待菌體融化,加入目的DNA(質(zhì)粒或連接產(chǎn)物),輕輕彈勻,冰浴靜置5 min。

3、用200 μL移液槍將上一步的混合物轉(zhuǎn)移到已經(jīng)37℃預(yù)熱的LB培養(yǎng)基上,均勻涂布。

4、將平板置于37℃培養(yǎng)箱倒置過夜培養(yǎng)。若進行藍(lán)白斑篩選操作,平板在37℃至少倒置培養(yǎng)15 h。

挑單菌落

用無菌的槍頭或牙簽將單個菌落挑至新一代快速菌落PCR Mix中混勻(2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix,Cat#10167ES),加入引物直接進行PCR反應(yīng)。共計挑   個單菌落,陽性率    (陽性條帶數(shù)/單菌落個數(shù))。

測序

(推薦使用一條載體通用測序引物+目的片段另一端引物送去測序驗證)

 

 

明星產(chǎn)品推薦

 

克隆實驗流程

產(chǎn)品定位

名稱

貨號

規(guī)格

載體、片段制備

高保真PCR

2× Hieff Canace® AdvanceFast PCR Master Mix (With Dye)

10164ES03/08

1 mL/5×1 mL

同源重組

1-7片段一步法定向連接,最快5分鐘完成重組反應(yīng)

Hieff Clone® Universal II One Step Cloning Kit

10923ES20/50

20 T/50 T

轉(zhuǎn)化

5 min快速完成感受態(tài)轉(zhuǎn)化

F DH5α化學(xué)感受態(tài)

11803ES80

10×100 μL

菌落PCR

快速PCR升級,可菌P且適用復(fù)雜模板擴增

2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix

10167ES03/08

1 mL/5×1 mL

目的片段保存、測序

TOPO克隆-兼容TA/平末端

Hieff Clone® Universal Zero TOPO TA/Blunt Cloning Kit

10906ES20

20 T

 



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