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衍生化是一種利用化學變換把化合物轉化成類似化學結構的物質。一般來說，一個特定功能的化合物參與衍生反應，溶解度，沸點，熔點，聚集態(tài)或化學成分會產(chǎn)生偏離。由此產(chǎn)生的新的化學性質可用于量化或分離，樣品的衍生化的作用主要是把難于分析的物質轉化為與其化學結構相似但易于分析的物質，便于量化和分離。
衍生一般有兩種，一種是柱前衍生，另一種則是柱后衍生，這兩者各有各的特點，柱前衍生指的是在分析物經(jīng)過色譜柱前與衍生試劑反應，反應產(chǎn)物在色譜柱上實現(xiàn)分離，實際分離的是衍生產(chǎn)物，檢測的也是衍生產(chǎn)物；而柱后衍生指的是分析物在色譜柱中實現(xiàn)分離后，在衍生池內與衍生試劑反應，檢測的是衍生產(chǎn)物。
1、柱前衍生的優(yōu)點分析：1)相對自由地選擇反應條件。2)不存在反應動力學的限制。3)衍生副產(chǎn)物可進行預處理。4)容易允許多步反應的進行。5)不需要復雜的儀器設備。6)有較多的衍生劑可選擇。但是柱前衍生所形成的衍生副產(chǎn)物可能對色譜分離造成較大困難，且在衍生化過程中，容易引入雜質，或損失樣品。
2、柱后衍生的優(yōu)點分析：1)分析物可以在其原有的形式下進行分離，容易選用已有的分析方法。2)重現(xiàn)性好，影響因素少，引入物質比較少。但是柱后衍生對于一定的溶劑和有限的反應時間來說，目前只有有限的反應可供選擇，除此之外，需要額外的儀器設備，可能有擴散問題。
當試劑與色譜柱流出物混合時，分析分離完成。因此，最重要的是分析物盡快反應。反應時間越長，則反應器所需的體積越大。體積較大時，峰形將變形。為了使譜帶擴散小，重要的是要使色譜柱和檢測器之間的總時間（以及因此的體積）盡可能的短。如果反應緩慢（超過一分鐘），可以使用高溫減少反應時間。
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