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光合儀：氣體交換原理，利用紅外氣體分析器（InfraRed Gas Analyzer IRGA）測(cè)量流經(jīng)葉片前后CO2和H2O的濃度變化，分析葉片與環(huán)境發(fā)生的氣體交換，用固定了多少CO2來(lái)表征光合作用的能力。常用的參數(shù)是凈光合速率，蒸騰速率，氣孔導(dǎo)度，胞間二氧化碳濃度等。氣體交換是非常經(jīng)典的光合作用測(cè)量方法，光合儀是常被用來(lái)測(cè)量氣體交換的儀器。
熒光儀：葉綠素?zé)晒庠?，通過(guò)檢測(cè)光合作用光能利用過(guò)程中葉綠素?zé)晒獾漠a(chǎn)量(F)，來(lái)分析光合作用光能吸收，轉(zhuǎn)化和分配。用葉綠素?zé)晒鈪?shù)來(lái)表征不同途徑能量分配的多少。常用的參數(shù)有光系統(tǒng)的大光能轉(zhuǎn)換效率(Fv/Fm), 實(shí)際光能轉(zhuǎn)換效率(Yield), 光化學(xué)淬滅(qP), 非光化學(xué)淬滅(NPQ), 電子傳遞速率（ETR）等。葉綠素?zé)晒夥ň哂袩o(wú)損，原位測(cè)量等優(yōu)勢(shì)，可以作為光合作用的有效探針，葉綠素?zé)晒鈨x廣泛應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)室和野外光合作用研究。
光合儀和熒光儀可以獨(dú)立存在，但是光反應(yīng)和暗反應(yīng)不會(huì)獨(dú)立運(yùn)行。所以，兩者沒(méi)有意義上的高下，因?yàn)楣夥磻?yīng)和暗反應(yīng)同樣重要。如果想全面的分析光合作用，光合儀和熒光儀都需要用到，使用方案是聯(lián)用，同步測(cè)量氣體交換和葉綠素?zé)晒狻?/span>
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