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技術(shù)服務(wù) 抗體測(cè)序服務(wù)

來(lái)源:安諾倫(北京)生物科技有限公司   2020年05月14日 16:30  

艾柏森生物科技有限公司作為值得信賴的抗體研發(fā)服務(wù)供應(yīng)商,擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),可為客戶提供的抗體測(cè)序服務(wù)。艾柏森生物打造的全新一代抗體測(cè)序平臺(tái),基于蔦槍法與抗體數(shù)據(jù)庫(kù)相結(jié)合的技術(shù)“Database Assisted Shotgun Sequencing”(DASS)技術(shù),這項(xiàng)技術(shù)還適用于其他亞型和不同形式的抗體,如:IGM,熒光偶聯(lián)抗體,固定化抗體,不同物種的抗體等。

 

等重氨基酸測(cè)序

與其它基于MS測(cè)序方法不同的是,我們可以分辨大多數(shù)等重氨基酸復(fù)合物

★ W可與GE、AD、SV區(qū)分

★ R可從GV中區(qū)別出來(lái)

★ Q可從GA、K中區(qū)別出來(lái)

★ N可從GG中區(qū)別出來(lái)

 

Database Assisted Shotgun Sequencing, DASS

Figure 1.Workflow of Service

 

運(yùn)用DASS技術(shù)對(duì)V、J、C片段測(cè)序

 

  目前已有的一些數(shù)據(jù)庫(kù)(如NCBI)雖包含抗體V、J、C片段序列,但是在抗體成熟的過(guò)程中,一個(gè)B細(xì)胞中的抗體基因要經(jīng)過(guò)體細(xì)胞突變的過(guò)程才會(huì)產(chǎn)生高親和力的成熟抗體。

  我們采用*的計(jì)算方法,并能匹配相應(yīng)物種的突變肽段,保證每條肽段都會(huì)被檢測(cè)到,且每一個(gè)氨基酸位點(diǎn)都會(huì)生成20-7-條MS/MS光譜,對(duì)難測(cè)序的proline和arginine的肽段也可實(shí)現(xiàn)測(cè)序。

 

Database Assisted Shotgun Sequencing, DASS

Figure 2.Sequence coverage is verified with the integrity of the combination of multipleLC-MS/MS datasets

 

CDR3區(qū)測(cè)序

  抗體輕鏈的CDR3去多由胚系基因編碼,而重鏈的CDR3區(qū)則由D基因編碼,D基因大部分區(qū)域由于受到核酸酶及末端轉(zhuǎn)移酶等重組酶的作用而發(fā)生基因重排,導(dǎo)致抗體重鏈CDR區(qū)在數(shù)據(jù)庫(kù)中無(wú)法進(jìn)行同源對(duì)比,而只能對(duì)其進(jìn)行de novo測(cè)序。高質(zhì)量的質(zhì)譜數(shù)據(jù)與高效率的數(shù)據(jù)挖掘算法的結(jié)合,使我們對(duì)抗體CDR3區(qū)域的解讀更為有力,我們可以測(cè)得數(shù)據(jù)庫(kù)中無(wú)同源序列的20kDa的蛋白質(zhì)。

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