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單細(xì)胞基因表達(dá)分析在基因表達(dá)研究中占有越來越重要的地位

來源:Bio-Techne   2019年08月21日 16:51  
   單細(xì)胞基因表達(dá)分析在基因表達(dá)研究中占有越來越重要的地位
   單細(xì)胞基因表達(dá)分析是一種快速分析基因表達(dá)信息的技術(shù),它通過快速和詳細(xì)分析成千上萬個(gè)表達(dá)序列標(biāo)簽來尋找出表達(dá)豐度不同的SAGE標(biāo)簽序列,從而接近完整地獲得基因組表達(dá)信息。
   單細(xì)胞基因表達(dá)分析技術(shù)與基因芯片一起為目前兩種常見的基因表達(dá)譜研究方法。隨著第三代測序技術(shù)的發(fā)展,通過構(gòu)建cDNA文庫,然后利用第二代測序技術(shù)的高通量優(yōu)勢對mRNA文庫進(jìn)行測序,進(jìn)而進(jìn)行基因表達(dá)譜分析的方法在基因表達(dá)譜研究中占有越來越重要的地位。
   單細(xì)胞基因表達(dá)分析又稱定量即時(shí)聚合酶鏈鎖反應(yīng),是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以螢光染劑偵測每次聚合酶鏈鎖反應(yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法技術(shù),有廣義概念和狹義概念。單細(xì)胞基因表達(dá)分析通過對PCR終產(chǎn) 物的分析或PCR過程的監(jiān)測,進(jìn)行PCR起始模板量的定量,用外標(biāo)法(熒光雜交探針保證特異性)通過監(jiān)測PCR過程(監(jiān)測擴(kuò)增效率)達(dá)到定量起始模板數(shù)的目的,同時(shí)以內(nèi)對照有效排除假陰性結(jié)果(擴(kuò)增效率為零) 。
   觀察到的數(shù)據(jù)是抽樣過程中產(chǎn)生的離散形式,也就是說總體是恒定的,表達(dá)量越高的基因在抽樣結(jié)果中所占的比例越大。單細(xì)胞基因表達(dá)分析表達(dá)量低的基因可能即便有也無法被檢測出來。當(dāng)然,重新對相同文庫進(jìn)行測序,還是有可能找到更多表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本。
 

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