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RNAi技術(shù)專有名詞詳解

來源:上海士鋒生物科技有限公司   2017年06月26日 07:56  

1.RNAi:(RNA interference)RNA干擾

一些小的雙鏈RNA可以、特異的阻斷體內(nèi)特定基因表達,促使mRNA降解,誘使細(xì)胞表現(xiàn)出特定基因缺失的表型,稱為RNA干擾(RNA interference,RNAi,也譯作RNA干預(yù)或者干涉)。它也是體內(nèi)抵御外在感染的一種重要保護機制。

2.sirna:(small interfering RNAs)小干擾RNA

一種短片斷雙鏈RNA分子,能夠以同源互補序列的mRNA為靶目標(biāo)降解特定的mRNA,這個過程就是RNA干擾途徑(RNA interference pathway)。

3.shRNAs:(RNA-Short hairpin RNAs)短發(fā)夾RNA是設(shè)計為能夠形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)的非編碼小RNA分子,短發(fā)夾RNA能夠通過RNA干擾來抑制基因的表達。Thomas Rosenquist"s group和Greg Hannon"s group聯(lián)合研究了在哺乳動物種系細(xì)胞中shRNAs的轉(zhuǎn)移導(dǎo)致基因長時間穩(wěn)定沉默的機制。4.bp:(Base Pair)堿基對兩個堿基(A和T,或者C和G)之間靠氫鍵結(jié)合在一起,形成一個堿基對。DNA的兩條鏈就是靠堿基對之間的氫鍵連接在一起,形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。

5.Base sequence:堿基序列DNA分子中堿基的排列順序。6.Base Sequence Analysis:堿基序列分析分析出DNA分子中堿基序列的方法(這種方法有時能夠全自動化)
cDNA:參見互補DNA。

7.cDNA:互補DNA以信使RNA為模板合成的DNA,常常采用互補DNA的一條鏈作為繪制物理圖譜時的探針。

8.Complementary sequence:互補序列以一條核苷酸鏈為模板,根據(jù)堿基互補規(guī)則形成的互補鏈,稱為該模板的互補序列。9.Genomic Library:基因組文庫對某個染色體,制備隨機產(chǎn)生的、相互之間有重疊部分的片段的克隆。

10.RISC:(RNA-induced silencing complex)RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物

在RNAi效應(yīng)階段,siRNA雙鏈結(jié)合一個核酶復(fù)合物從而形成所謂RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物。激活RISC需要一個ATP依賴的將siRNA解雙鏈的過程。激活的RISC通過堿基配對定位到同源mRNA轉(zhuǎn)錄本上,并在距離siRNA3"端12個堿基的位置切割mRNA(3, 18, 27, 29)。盡管切割的機制現(xiàn)在還是未知,研究表明每個RISC都包含一個siRNA和一個不同于Dicer的RNA酶。

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