為地球上生命機(jī)器繞緊弦的是光合作用。地球上有一些自由能的來(lái)源火山或溫泉的熱量，地殼中某些元素的放射性，然而這些來(lái)源必竟是稀少而分散的。地球上生物的普遍分布是與從地球以外供應(yīng)的、極為豐富的自由能來(lái)源緊密聯(lián)系的，這種自由能就是從太陽(yáng)輻射到地球上的日光能，植物的光合作用是把日光給生命之鐘繞緊弦的過(guò)程。
從植物的光合作用中看到，熱力學(xué)一定律在廣泛的范圍內(nèi)可得到證實(shí)，生命活動(dòng)的能量來(lái)自光能。熱力學(xué)第二定律認(rèn)為，這是不可能的。生活的有機(jī)體不能違反熵的原則，不可能不付出任何代價(jià)地從無(wú)序狀態(tài)產(chǎn)生有序狀態(tài)，其結(jié)果只能是熵的增加，除了某些細(xì)菌以外，所有生物的生命活動(dòng)所需的自由能都來(lái)自光合作用的逆轉(zhuǎn)。
人們時(shí)常談到“有機(jī)物質(zhì)的含能量”，這是一種草率的說(shuō)法。燃燒能不能在有機(jī)物質(zhì)中利用，而在有機(jī)物質(zhì)+氧的系統(tǒng)中才有用，為了給生命過(guò)程提供能量，有機(jī)物質(zhì)和氧(兩者都從光合作用中產(chǎn)生)必須有機(jī)會(huì)進(jìn)行逆反應(yīng)，即光合作用的逆轉(zhuǎn)。這個(gè)逆反應(yīng)就是呼吸作用，這是一個(gè)緩慢的、有節(jié)制的燃燒，沒(méi)有氧氣的生命活動(dòng)即無(wú)氧生活，只存在于某些不需氧、而能從化學(xué)反應(yīng)中取得能量的微生物中。
生物可以利用從食物(動(dòng)物)得到的物質(zhì)，或者它們自己由二氧化碳和水合成的物質(zhì)(植物)作為呼吸基質(zhì)，后者稱之為內(nèi)源呼吸但是有不少植物也可利用外界供給的有機(jī)物質(zhì)(食肉植物甚至可以消化昆蟲(chóng)!)這是外源呼吸。動(dòng)物只可能有外源呼吸。從化學(xué)反應(yīng)總結(jié)果看，呼吸作用是光合作用的逆轉(zhuǎn)，這兩個(gè)過(guò)程不同之處在于，一個(gè)物質(zhì)向高能位轉(zhuǎn)運(yùn)，因而需要由外界供應(yīng)大量的自由能；而另一個(gè)是物質(zhì)由高能位走向低能位，不需要這種供應(yīng)。
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