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單細胞柔性分選系統(tǒng)結(jié)合CRISPR Cas9技術(shù)新應(yīng)用

閱讀:151        發(fā)布時間:2024-5-27

近期,一篇文章報道了巨噬樣細胞的SAMHD1基因編輯最新進展,揭示了SAMHD1磷酸化調(diào)控、HIV-1限制和細胞dNTP水平之間的復(fù)雜關(guān)系。

單細胞柔性分選系統(tǒng)結(jié)合CRISPR Cas9技術(shù)新應(yīng)用

SAM和HD結(jié)構(gòu)域蛋白1 (SAMHD1)是一種dNTP三磷酸水解酶(dNTPase)和免疫缺陷病毒1 (HIV-1)的有效限制性因子,活躍在骨髓細胞和靜息CD4+ T細胞中。SAMHD1的抗病毒活性受殘基T592的去磷酸化調(diào)控。然而,T592磷酸化對dNTPase活性的影響仍存在爭議。SAMHD1的其他細胞功能是否影響抗病毒限制尚不清楚。

作者報道了BLaER1細胞作為一種新的人類巨噬樣細胞HIV-1感染模型結(jié)合CRISPR/Cas9敲入(KI)技術(shù)將特異性突變引入 SAMHD1位點以研究生理背景下的突變。轉(zhuǎn)分化的BLaER1細胞含有活性去磷酸化的SAMHD1,可阻斷HIV-1報告病毒的感染。正如預(yù)期的那樣,純合子T592E突變,而不是T592A,緩解了HIV-1逆轉(zhuǎn)錄的阻滯。將VLP-Vpx共同遞送到SAMHD1 T592E KI 突變細胞中并沒有進一步增強HIV-1感染,這表明缺乏獨立于T592去磷酸化的SAMHD1介導(dǎo)的額外抗病毒活性。T592E KI細胞保留的dNTP水平與WT細胞相似,表明SAMHD1的抗病毒和dNTP酶活性解耦。SAMHD1中催化位點的完整性對于抗病毒活性至關(guān)重要,然而在攜帶催化核心突變的細胞中觀察到HIV-1 限制與整體細胞dNTP水平的低相關(guān)性??傊?,強調(diào)HIV-1限制,SAMHD1酶功能和T592磷酸化調(diào)節(jié)之間關(guān)系的復(fù)雜性,為內(nèi)源性和生理背景下的研究提供了新的工具。

研究中作者將BLaER1細胞進行CRISPR/Cas9基因編輯后使用Namocell  Hana單細胞分離儀進行單細胞分選,或者有限稀釋法進行單克隆培養(yǎng),篩選出目的細胞克隆。
單細胞柔性分選系統(tǒng)結(jié)合CRISPR Cas9技術(shù)新應(yīng)用

圖3. CRISPR/Cas9敲入產(chǎn)生SAMHD1突變體的流程


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