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單細胞分選在生物信息學中起到一個重要角色
閱讀：246 發(fā)布時間：2023-6-25
單細胞分選（SingleCellSorting）技術(shù)是一種可以將單個細胞從復雜的混合樣品中進行快速篩選和富集的高通量技術(shù)。該技術(shù)已經(jīng)廣泛應用于生物信息學研究中，尤其在腫瘤、免疫學、發(fā)育生物學等領域起到了至關(guān)重要的作用。
在單細胞分選過程中，流式細胞儀被廣泛應用于實現(xiàn)對各類類型組成樣品中具有特定熒光或其他標志性抗原的單個活體細胞進行誘導及捕獲，并高效地回收目標基因組或轉(zhuǎn)錄組檢測所需數(shù)量。
通過這種方式獲取到大規(guī)模而又完整的布谷鳥圖譜（bird's-eyeview），我們就能夠更加全面準確地揭示每個調(diào)控區(qū)域?qū)虮磉_影響的精度與范圍。
除此之外，在當前越來越多地采取“全基因組”水平上進行數(shù)據(jù)挖掘時，利用該項技術(shù)篩選出人群內(nèi)感染率較高者以及不同亞型間差異顯著性分析也變得更為便利和直觀。同時在檢驗致癌基因及其調(diào)控機制、研究分化過程和細胞信號傳遞通路等方面，單細胞分選也發(fā)揮了重要的作用。
但是在應用中，仍然存在一些限制和難以克服的技術(shù)問題。例如，在大樣品量與小樣品量之間做抉擇時會帶來不同模式的噪聲或誤差；同時，在測序過程中出現(xiàn)高達10-25%丟失率將會使得數(shù)據(jù)質(zhì)量下降；此外還有成本高昂等問題需要考慮。
總體而言，盡管單細胞分選技術(shù)面臨著許多挑戰(zhàn)和困難，但它已經(jīng)被證明是一個強有力的工具來深入理解生物信息學領域復雜流程。未來我們可以通過對該項技術(shù)進行持續(xù)改進與優(yōu)化，并結(jié)合其他科研手段實現(xiàn)更加全面地研究方法論并為各類相關(guān)應用任務提供支撐。