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單細(xì)胞RNA測序的技術(shù)流程及應(yīng)用
閱讀：960 發(fā)布時間：2022-7-11
單細(xì)胞RNA測序是指在單細(xì)胞水平上對轉(zhuǎn)錄組進行測序的方法，是目前生物學(xué)研究領(lǐng)域的一項熱點技術(shù)。與普通高通量RNA測序相比，單細(xì)胞RNA測序可以分辨單個細(xì)胞間的生物學(xué)差異，識別出易被忽視的罕見細(xì)胞群體和細(xì)胞亞群。
測序技術(shù)與其他RNA測序的基本原理相似，流程包括細(xì)胞制備、文庫構(gòu)建、測序和數(shù)據(jù)分析。其中單細(xì)胞制備和單細(xì)胞文庫構(gòu)建是重要的環(huán)節(jié)，決定了數(shù)據(jù)質(zhì)量、測序通量、精確度、靈敏度和可重復(fù)性。單細(xì)胞的分離制備技術(shù)目前主要有流式細(xì)胞分選術(shù)、免疫磁珠細(xì)胞分選技術(shù)、顯微操作法、微流控技術(shù)等。
單細(xì)胞RNA測序在皮膚病學(xué)研究領(lǐng)域的應(yīng)用：
目前在皮膚相關(guān)領(lǐng)域使用測序技術(shù)的研究較少。有研究者首先利用這種技術(shù)研究了小鼠正常皮膚表皮的結(jié)構(gòu)和組成，顯示測序技術(shù)在識別皮膚角質(zhì)形成細(xì)胞亞群上的強大能力。
利用單細(xì)胞RNA測序可發(fā)現(xiàn)固有淋巴樣細(xì)胞（ILC）在表皮、真皮和皮下組織這3個部位有特異性的轉(zhuǎn)錄表達譜。表皮ILC可以通過抑制Notch信號通路限制皮脂腺細(xì)胞的生長，可能影響皮膚表面具有抗菌活性的游離脂肪酸的分泌，從而限制革蘭陽性菌的共生。
這為研究皮膚稀有的免疫細(xì)胞提供了技術(shù)可能，進一步探究了皮膚免疫細(xì)胞與皮脂腺、共生菌群的關(guān)系，為皮膚免疫細(xì)胞如何調(diào)節(jié)皮膚穩(wěn)態(tài)提供了新的思路。
單細(xì)胞RNA測序技術(shù)是研究腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性和腫瘤微環(huán)境組成的強有力工具，已在乳腺癌、頭頸部鱗狀細(xì)胞癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤等疾病中得到了應(yīng)用。
其對黑素瘤的分型和腫瘤的精準(zhǔn)治療具有重要的指導(dǎo)意義，而這些結(jié)果無法通過普通高通量RNA測序得到，證明單細(xì)胞RNA測序在研究腫瘤亞群和腫瘤微環(huán)境中具有不能比擬的作用。