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Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一種發(fā)近紅外（NIR）熒光的花青素?zé)晒馊玖稀Ｋ南庀禂?shù)高，熒光也很亮，并且對pH不敏感，并且由于它的熒光波長（Em：~700nm）恰好處于肌體組織近紅外窗口 I 的區(qū)域（肌體的血液，體液和組織此區(qū)域背景熒光弱，而長波長穿透性強），所以Cy5.5常應(yīng)用于小動物活體體內(nèi)成像中。 Cy5.5可以用來標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，納米粒等，它***常見的使用是標(biāo)記核酸分子（DNA和RNA）。

伯胺基(primary amine)是生物標(biāo)記反應(yīng)中常用的基團。蛋白表面賴氨酸側(cè)鏈(residue)官能團就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester)，異氰酸酯(isothiocyanate, ITC)或其它活化基團反應(yīng)生成穩(wěn)定鏈接，從而把Cy5.5分子連接到目標(biāo)分子上。

Cy5.5-伯胺的水溶性較低，所以在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)需要使用有機共溶劑，常用有機溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標(biāo)記的分子對有機溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy5.5-伯胺。兩者的光譜性質(zhì)幾乎一致，因此大部分應(yīng)用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)不需要使用有機共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強標(biāo)記效率。

Cy5.5-伯胺標(biāo)記后的產(chǎn)物Ex/Em是680/698nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。

英文名：NH2-Cy5.5

Cy5.5-amine

Cyanine5.5 amine 

中文名：花青素CY5.5氨基

CAS號：2097714-44-6 (without anion)，2097714-45-7 (chloride)

分子式：C46H58Cl2N4O

分子量：753.88

結(jié)構(gòu)式：

ex/em：680/698 nm (PBS緩沖液)

消光系數(shù)(ε)：209000 L?mol?1?cm?1

***產(chǎn)率(Φ)：0.2

外觀：深藍(lán)色固體

溶解性：可溶于氯仿，甲醇，乙腈，DMF等有機溶劑，難溶于水

保存條件：避光，干燥，-20℃保存

運輸條件：低溫運輸

簡介：氰基5.5（Cy5.5氨基）胺衍生物。該染料含有一個游離胺基，可以與多種功能結(jié)合，包括NHS酯和環(huán)氧化合物。氰基5.5是一種遠(yuǎn)紅色染料，適用于活體成像和需要低熒光背景的應(yīng)用。

注意事項：

1）Cy5.5-伯胺水溶性較低，標(biāo)記反應(yīng)可在有機溶劑中進行或者含有機助溶劑的水相中進行。

2）標(biāo)記時使用不含氨基的緩沖體系，比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液；或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等，它們會和Cy5.5上的伯胺競爭。高濃度咪唑(imidazole)也會影響反應(yīng)。

3）標(biāo)記反應(yīng)不要放在強光下，因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。

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