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  新一代的D8QUEST/VENTURE配備了更強的光源，更靈敏，更大的探測器，讓我們能夠更高效地收集更高分辨率的數(shù)據(jù)。晶體數(shù)據(jù)分辨率的提高，讓我們能夠更清晰地看到原子世界的奧秘，比如成鍵電子，孤對電子等。

  然而50多年來，我們使用的結(jié)構(gòu)精修方法，采用的是獨立原子模型（Independent Atom Model, IAM），無法完美地描述真實的電子云形狀。因而對于高分辨率的數(shù)據(jù)，IAM結(jié)構(gòu)精修方法反而會導(dǎo)致更高的R1值。為此，很多時候為了發(fā)表文章，或者迎合checkcif，我們只好忍痛去截斷分辨率，白白浪費了很多非常有意義的數(shù)據(jù)。

  而現(xiàn)在，Bruker新的APEX3軟件開發(fā)了IDEAL結(jié)構(gòu)精修方法，在IAM的結(jié)構(gòu)精修的基礎(chǔ)上，可以將成鍵電子以及孤對電子的貢獻加入到結(jié)構(gòu)模型之中，從而獲得更真實，更佳質(zhì)量的晶體結(jié)構(gòu)。

 ▲Fig.1 IAM 結(jié)構(gòu)模型下的殘余電子密度

獨立原子模型（IAM） VS 多極結(jié)構(gòu)模型（MM）

獨立原子模型

原子被認為相互之間是獨立的

原子的位置以及位移參數(shù)僅能夠計算正確晶格位置的原子類型以及占有率

IAM沒有考慮到原子間的區(qū)域

IAM沒有描述成鍵，孤對電子，電荷，電荷轉(zhuǎn)移的效應(yīng)

多極模型

MM方法模擬了原子間區(qū)域，重要的特征：化學(xué)鍵

它將總電荷密度分配給球諧函數(shù)，即所謂的多極

比如原子間向量上的偶極子可以解釋鍵電荷密度

 ▲Fig.2 IAM VS MM

APEX3-IDEAL，更好的結(jié)構(gòu)精修方法

  為了更好地精修高分辨率的數(shù)據(jù)，新的APEX3軟件，開發(fā)了更完美的結(jié)構(gòu)精修方法IDEAL(Invariom Derived Electron AnaLysis)。簡潔，智能的軟件界面，讓我們能夠更好地修正高分辨率的數(shù)據(jù)，從而獲得更精細的結(jié)構(gòu)信息。APEX3*的XL程序可以直接調(diào)用IDEAL，精修結(jié)果和Checkcif*兼容。

 ▲ APEX3 Refinement

IDEAL結(jié)構(gòu)精修舉例

 ▲Fig.4 Examples of IDEAL Refinement Results