通風管道的設計，需要考慮風機的成本，排氣物質(zhì)的種類，風速，噪音，管道直徑，長度，彎曲度，材質(zhì)等各種因素。凈氣型通風柜的管道系統(tǒng)用一臺通風機與一臺通風柜，用單一管道連接是的方法。但是，由于沒有那么多的管道空間，選擇室外安裝的一臺通風機處理多臺通風柜的排風比較經(jīng)濟等原因，集中管道施工依然很多。這時需要注意以下幾點： 
    1、有機類、無機類、過氧酸類、放射性同位素必須采用各個分離的管道系統(tǒng)，而且各自的系統(tǒng)的通風柜不得使用以外的藥品。因為從各個通風柜產(chǎn)生的有害氣體若混合到同一管道有產(chǎn)生爆炸的危險。 
    2、盡量將管道設計在同一層排氣。比重大的氣體冷卻后形成冷凝水有害物有流入后面通風柜的危險。 
    3、一臺通風機連接的通風柜越少越好。 
    4、通風管道盡可能直立，而且高度越高越好。
    5、通風機盡可能安裝在管道的末端，（屋頂上等處）。 
    6、排風管道的末端應盡量避開補風管道的進氣風口，防止排出的有害氣體通過通風管道再被送進通風柜。