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同源重組(HR)缺陷與DNA重排和細(xì)胞遺傳畸變有關(guān)。矛盾的是，與hr缺陷型癌癥相關(guān)的DNA重排類型對染色體結(jié)構(gòu)的影響微乎其微。

近日，為了解決這一明顯的矛盾，研究人員結(jié)合了46例BRCA1-或brca2突變型乳腺癌的數(shù)千個(gè)具有深連鎖閱讀WGS的腫瘤的短讀全基因組測序(WGS)圖譜的基因組圖譜分析。

相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上，文章標(biāo)題為：“Long-molecule scars of backup DNA repair in BRCA1- and BRCA2-deficient cancers"。

這些數(shù)據(jù)揭示了一類富含hr缺陷的重排，稱為互易對。鏈讀WGS顯示，具有相同重排取向的互反對產(chǎn)生了兩種不同的染色體結(jié)果之一，只能通過長分子數(shù)據(jù)來區(qū)分。一個(gè)(順式)結(jié)果對應(yīng)于一個(gè)小片段的復(fù)制和粘貼到一個(gè)遙遠(yuǎn)的位點(diǎn)，第二個(gè)(反式)結(jié)果是一個(gè)準(zhǔn)平衡的易位或多兆堿基反轉(zhuǎn)，在每個(gè)節(jié)點(diǎn)上都有大量(10 kb)的重復(fù)。我們提出了一個(gè)獨(dú)立于hr的復(fù)制-重啟修復(fù)機(jī)制來解釋互惠對結(jié)果的全部范圍。鏈接閱讀WGS還發(fā)現(xiàn)單鏈退火是人類癌癥中BRCA2缺乏特異性的修復(fù)途徑。將這些特征整合到分類器中可以提高BRCA1-和brca2缺陷基因組之間的區(qū)分。

總之，該研究的數(shù)據(jù)揭示了在hr缺陷細(xì)胞中，BRCA1或BRCA2缺乏癥的重排類型是細(xì)胞遺傳畸變的來源。