| 導(dǎo)讀 | 斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)現(xiàn)衰老的新奧秘：相比于年輕人，老年人的免疫細胞攜帶更多的染色質(zhì)修飾。而且這些修飾差異主要來源于環(huán)境。 |
理解任何多細胞生命系統(tǒng)的前提是理解“細胞”，今天單細胞研究已經(jīng)不再只是紙上談兵了，已經(jīng)有許多實驗室展開了單細胞研究，近期Science，Cell就接連公布了這方面的成果。
免疫細胞是如何衰老的？
斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)現(xiàn)衰老的新奧秘：相比于年輕人，老年人的免疫細胞攜帶更多的染色質(zhì)修飾。而且這些修飾差異主要來源于環(huán)境。
這有助于解釋為什么老年人的免疫系統(tǒng)會衰退，為什么不同人的免疫系統(tǒng)以不同的速率老化，為什么環(huán)境在產(chǎn)生這些與年齡相關(guān)的差異方面比遺傳更重要？
這一研究成果公布在4月26日的Cell雜志上。研究人員通過一種快速，準確的新方法，一個個的分析單細胞，總共分析了上億個細胞，發(fā)現(xiàn)老年人的免疫細胞比年輕人的免疫細胞指令更加模糊不清楚。
具體來說研究人員利用質(zhì)譜流式細胞技術(shù)：EpiTOF 從單細胞水平分析了免疫細胞的染色質(zhì)修飾情況。他們分析了22種不同免疫細胞內(nèi)40種不同類型的表觀遺傳標記，共積累了約217億個數(shù)據(jù)點，并進行了專門的數(shù)據(jù)解析。
作者表示，“免疫系統(tǒng)在各種疾病中發(fā)揮著重要作用。然而目前我們過分關(guān)注遺傳學(xué)，忽略了人類免疫學(xué)和環(huán)境影響的影響。”
深度解析三陰乳腺癌
美國MD安德森癌癥中心聯(lián)合瑞典卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員利用單細胞測序?qū)θ幦橄侔┱归_分析，表明耐藥性是來源于現(xiàn)有的帶有基因突變的克隆。
研究人員利用單細胞DNA和RNA測序，以及大量細胞的外顯子組測序，分析了20名治療過程中的三陰乳腺癌患者。Illumina深度外顯子組測序發(fā)現(xiàn)10名患者的腫瘤消退，而另10名患者仍有腫瘤細胞存在。之后，他們對其中的8名開展了單細胞分析。
他們使用BD的FACSAria II流式細胞儀來分選單個細胞，并利用混合文庫和Illumina的新一代測序技術(shù)來分析。他們通過DNA測序分析了900個單細胞，通過RNA測序分析了6,862個細胞，發(fā)現(xiàn)化療中出現(xiàn)的拷貝數(shù)畸變是預(yù)先存在且適應(yīng)性選擇的，而表達譜是通過轉(zhuǎn)錄重編程獲得的。
具體見：《Cell》：單細胞測序深度解析三陰乳腺癌
神奇的生命起源
這一系列三篇文章分別利用單細胞技術(shù)研究了心臟、神經(jīng)和血細胞的發(fā)育過程，繪制了兩種模式動物：非洲爪蟾和斑馬魚從受精卵到完整胚胎的基因表達圖譜。
采用的技術(shù)分別有轉(zhuǎn)座子的條形碼方法：TracerSeq，單細胞測序技術(shù)inDrop。
具體見：三篇《Science》解讀生命誕生奇跡：為什么一個受精卵能創(chuàng)造整個身體
真渦蟲的單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜
兩個研究小組利用Drop-seq技術(shù)來繪制整個復(fù)雜動物的細胞圖譜，并建立細胞譜系。
在*項研究中，懷特黑德生物醫(yī)學(xué)研究所和麻省理工學(xué)院的研究人員報告稱，他們基本上能夠確定地中海渦蟲的每種細胞的轉(zhuǎn)錄組。他們測序了50,000多個單細胞，并確定了至少44個不同的細胞群，以及150多個亞群。在第二項研究中，德國Max Delbrück分子醫(yī)學(xué)中心的研究人員也繪制了地中海渦蟲的細胞類型圖譜以及譜系樹。他們測序了20,000多個單細胞，鑒定出至少51個細胞群和23個獨立的細胞譜系。
（轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)）
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