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中級(jí)會(huì)員 | 第15年

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人巨細(xì)胞病毒病毒基因組測(cè)序

時(shí)間:2013-6-24閱讀:1513
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 人巨細(xì)胞病毒是一種很常見的皰疹病毒,感染約50-100%的成人,但通常沒有不良影響,并且它可以保持潛伏多年。人巨細(xì)胞病毒感染是比較常見的,發(fā)展中國(guó)家感染人數(shù)比發(fā)達(dá)國(guó)家人數(shù)多。

該病毒可導(dǎo)致出新生兒生缺陷和免疫系統(tǒng)受損,可能會(huì)導(dǎo)致致命疾病。該病毒也與癌癥發(fā)展有關(guān)聯(lián)。這項(xiàng)新的研究分析了病毒的蛋白質(zhì)組,并描述了所有表達(dá)的蛋白質(zhì)。

研究人員認(rèn)為,以往研究潛在編碼蛋白質(zhì)的基因組很大程度上是計(jì)算機(jī)模型上的,這是不完整的。二十多年來(lái),16個(gè)病毒株人巨細(xì)胞病毒基因組已被測(cè)序。

這是一個(gè)特別大的病毒基因組中,約240,000個(gè)堿基對(duì)。該小組開始研究感染HCMV的人成纖維細(xì)胞的核糖體。核糖體是細(xì)胞內(nèi)制造蛋白質(zhì)的細(xì)胞器。他們用質(zhì)譜??分析以確定是否存在預(yù)測(cè)的蛋白質(zhì)。

研究發(fā)現(xiàn)了數(shù)以百計(jì)的蛋白質(zhì)編碼基因,這些基因此前未被確定在基因組中。編碼蛋白質(zhì)的DNApian段被稱為開放閱讀框架,在基因組序列的分析基礎(chǔ)上,以前的研究預(yù)測(cè)有200幀。

了解病毒基因組表達(dá)的蛋白質(zhì)可能有助于確定該病毒是如何影響宿主細(xì)胞的。相關(guān)研究論文發(fā)表在Science上,研究小組說(shuō)核糖體分析技術(shù)和質(zhì)譜相結(jié)合方法可用于研究其他復(fù)雜病毒的蛋白質(zhì)組。

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