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上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司
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Paragon Genomics CleanPlex說明書
CleanPlex® Ready-to-Use NGS Panels | Product Sheet CleanPlex® BRCA1 & BRCA2 Panel v3
CleanPlex®即用NGS面板|產(chǎn)品表CleanPlex®BRCA1&BRCA2面板v3
Sensitive detection of somatic and germline mutations in BRCA1and BRCA2
BRCA1和BRCA2體細(xì)胞和生殖系突變的敏感檢測
亮點(diǎn)•目標(biāo)區(qū)域的高覆蓋率以整個(gè)編碼區(qū)域?yàn)槟繕?biāo)，包括在所有目標(biāo)編碼外顯子周圍填充20個(gè)堿基•敏感檢測僅使用20 ng DNA檢測低至1%變異等位基因頻率的體細(xì)胞突變•快速，簡化的工作流程使用快速的三步協(xié)議在3小時(shí)內(nèi)生成可排序的庫•性能使用CleanPlex®技術(shù)準(zhǔn)備高質(zhì)量的NGS庫，具有的目標(biāo)一致性和覆蓋均勻性性能，以便有效地使用排序讀取并降低成本
CleanPlex®BRCA1和BRCA2面板v3是一種多重PCRBase靶向重排序分析，旨在簡化BRCA1和BRCA2基因體細(xì)胞和生殖系變異的評估。該小組的目標(biāo)是BRCA1和BRCA2的所有外顯子區(qū)域和20bpof側(cè)翼內(nèi)含子序列。從20納克的DNA開始，測序準(zhǔn)備好的文庫可以在3小時(shí)內(nèi)使用一個(gè)簡化的工作流程來準(zhǔn)備。該面板經(jīng)過優(yōu)化，可提供高目標(biāo)性能和高覆蓋均勻性的數(shù)據(jù)，以確保高效使用順序讀取。
靈敏的檢測CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3只需要20 ng輸入DNA（每個(gè)引物池10 ng），就可以檢測1%頻率的體細(xì)胞突變。平均擴(kuò)增子大小為148bp，與從FFPE組織中分離的DNA等降解樣品也相容。
CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3規(guī)格
參數(shù)規(guī)范富集方法多重PCR測序平臺(tái)Illumina®離子流™ 基因數(shù)2靶點(diǎn)BRCA1和BRCA2基因的全外顯子累積靶點(diǎn)大小19785bp變異型SNV，索引若干擴(kuò)增子237擴(kuò)增子大小111-200bp（平均148bp）引物池?cái)?shù)2輸入DNA要求10-40ng/池（推薦10 ng/池）血液、唾液樣本類型基因組DNA，或組織；FFPE DNA總分析時(shí)間3小時(shí)手控時(shí)間75分鐘設(shè)計(jì)覆蓋率100%覆蓋均勻性（平均覆蓋率>0.2X的靶點(diǎn)）≥95%靶點(diǎn)對齊讀數(shù)≥95%A。SNVs：單核苷酸變異；索引：插入缺失
CleanPlex流線型工作流CleanPlex BRCA1&BRCA 2 Panel v3提供了一個(gè)快速、流線型的工作流。從純化和定量DNA開始，基于多重PCR的方案可以在3小時(shí)內(nèi)完成，75分鐘的操作時(shí)間，使用三步工作流程，小的管到管傳輸。每個(gè)步驟包括一個(gè)熱循環(huán)或培養(yǎng)條件，然后使用磁珠進(jìn)行“帶珠”純化.
CleanPlex背景清洗化學(xué)CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3由Paragon Genomics的CleanPlex技術(shù)提供動(dòng)力，該技術(shù)使用專有的多重PCR背景清洗化學(xué)來有效去除非特異性PCR產(chǎn)品，從而獲得宜的目標(biāo)富集性能和測序讀數(shù)的有效使用.
Recommended Sample Multiplexing for CleanPlex BRCA1 & BRCA2 Panel v3
每次運(yùn)行的儀器樣品™ 100系統(tǒng)7 MiniSeq™ 系統(tǒng)（中輸出）14 MiniSeq系統(tǒng)（高輸出）45 MiSeq®系統(tǒng)（v2化學(xué)納米）1 MiSeq系統(tǒng)（v2化學(xué)微）7 MiSeq系統(tǒng)（v2化學(xué)）27 MiSeq系統(tǒng)（v3化學(xué)）45 A.每次運(yùn)行的樣品預(yù)期平均讀取深度為5000x。
推薦
用于檢測種系突變：每次運(yùn)行的儀器樣品™ 100系統(tǒng)73 MiSeq®系統(tǒng)（v2化學(xué)納米）18 MiSeq系統(tǒng)（v2化學(xué)微米）73 B。每次運(yùn)行的樣品預(yù)期平均讀取深度為500倍。
產(chǎn)品SKU CleanPlex BRCA1&BRCA2 Panel v3（8個(gè)反應(yīng)）916112
CleanPlex BRCA1&BRCA2 Panel v3（96個(gè)反應(yīng)）916113
CleanPlex雙索引PCR引物，適用于Illumina集合A1（16個(gè)索引，16個(gè)反應(yīng)）716005
CleanPlex雙索引PCR引物，適用于Illumina集合A（96個(gè)索引，96反應(yīng)）716006
清潔磁珠（1毫升）718001清潔磁珠（5毫升）718002清潔磁珠（60毫升）718003
