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ZFNs動物模型

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ZFNs動物模型

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   上海達(dá)為科生物科技有限公司,位于上海長江軟件園,公司目前具備較好的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)技術(shù)服務(wù)平臺,能夠為廣大客戶提供醫(yī)學(xué)科研樣本檢測、合作研究、開發(fā)及生產(chǎn)服務(wù)。

公司擁有專業(yè)的實驗室、先進(jìn)的實驗設(shè)備和經(jīng)驗豐富的科研技術(shù)人員。技術(shù)團(tuán)隊包括研究員(博士后)2人,助理研究員(博士)4人,核心研究員(碩士)15人,主要致力于基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、生物化學(xué)、病理檢測、基因檢測等技術(shù)在科研中的應(yīng)用與推廣。通過高度細(xì)分、較好的服務(wù)平臺,為廣大客戶提供了完善的技術(shù)解決方案和服務(wù)。目前,,涉及臨床醫(yī)學(xué)、腫瘤生物學(xué)、免疫學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)等生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)等諸多領(lǐng)域。

我們的目標(biāo)是為了使您的工作更輕松、更快捷。為了實現(xiàn)一站式服務(wù)我們不斷更新實驗方法和引進(jìn)新的產(chǎn)品,控制和降低各種成本,為您的研究加油。這既是一項長期而艱巨的工作,又是一項光榮的工作,同時也是我們企業(yè)發(fā)展的動力源泉。

 

 

 

 

制作動物模型 細(xì)胞培養(yǎng) 分子生物學(xué)檢測 病理學(xué)形態(tài)檢測 蛋白質(zhì)技術(shù) 免疫學(xué)檢測 提供培訓(xùn)服務(wù)各種檢驗儀器設(shè)備、玻璃儀器及器具、一次性耗材等

一、技術(shù)原理與核心機(jī)制

ZFNs 是第一代可編程基因編輯工具,通過融合 DNA 結(jié)合域(鋅指蛋白)與 DNA 切割域(FokI 核酸酶)實現(xiàn)靶向編輯:

  1. 鋅指蛋白結(jié)構(gòu)域

    • 由 30-34 個氨基酸重復(fù)單元構(gòu)成,每個單元通過 第 12、13 位可變殘基(RVDs) 識別特定堿基:

RVD 類型識別堿基特異性
NIA
NGT
HDC
NNG/A中等
  • 單個鋅指識別 3 bp,串聯(lián) 3-6 個可靶向 9-18 bp 序列。

  1. FokI 切割域

    • 需 二聚化 才能激活切割功能 → ZFNs 需成對設(shè)計(左臂/右臂),切割位點位于兩臂結(jié)合位點之間(間隔區(qū) 5-7 bp)。

  2. 編輯機(jī)制

    • 雙鏈斷裂(DSB)→ 細(xì)胞啟動修復(fù)路徑:

  • 非同源末端連接(NHEJ) :隨機(jī)插入/缺失(Indels),導(dǎo)致基因敲除。

  • 同源定向修復(fù)(HDR) :需外源修復(fù)模板(如 ssODN),實現(xiàn)點突變或基因插入。

技術(shù)突破:shou次實現(xiàn)哺乳動物基因組靶向編輯(2005 年),開啟精準(zhǔn)基因編輯時代 。


二、動物模型構(gòu)建流程與技術(shù)優(yōu)化

(一)標(biāo)準(zhǔn)化操作步驟

(二)關(guān)鍵技術(shù)參數(shù)優(yōu)化

步驟核心操作創(chuàng)新優(yōu)化
靶點設(shè)計避開高重復(fù)/甲基化區(qū)域,間隔區(qū) 5-7 bp軟件預(yù)測(ZiFiT)提升結(jié)合效率 
鋅指組裝模塊化串聯(lián)法
  • 3-6 個鋅指單元串聯(lián)

  • Golden Gate 克隆(BsaI/BsmBI) | 6 天完成構(gòu)建,成功率 >80%  |
    表達(dá)載體 | 雙啟動子載體(CMV/T7),支持 mRNA 合成與蛋白表達(dá) | 適配多物種(斑馬魚、小鼠、豬)  |
    遞送方式 | - 受精卵顯微注射 ZFNs mRNA

  • 體細(xì)胞轉(zhuǎn)染 + 核移植(大型動物) | mRNA 遞送減少脫靶  |
    修復(fù)增強(qiáng) | 聯(lián)合 ssODN 模板 + NHEJ 抑制劑(SCR7) | HDR 效率提升 3 倍  |


三、多物種應(yīng)用案例與模型優(yōu)勢

(一)典型物種與疾病模型

物種靶基因疾病模型效率/表型研究價值
斑馬魚golden白化病95% F0 代色素缺失 發(fā)育基因功能篩選
小鼠Rag2/IL2rg免疫缺陷模型雙基因敲除,人源化移植平臺 腫瘤免yi治療研究
GGTA1異種器guan移植模型敲除 α-Gal 抗原,降低超急性排斥 人源化器官開發(fā)
果蠅yellow體色突變生殖系突變率 5.7%(動物模型)基因功能保守性驗證

(二)不可替代性應(yīng)用場景

  1. 高 GC 區(qū)域編輯

    • 無 PAM 序列限制,可靶向 CRISPR/Cas9 無法編輯的區(qū)域 。

  2. 低脫靶率需求

    • 治療性編輯中脫靶率 <0.1%(CRISPR 為 1-10%)。

  3. 大型動物模型

    • 豬、牛等物種中免疫原性低于 CRISPR 。




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