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BTP-S00106 PLS-DA/OPLS-DA二維圖檢測技術服務

參考價 600
訂貨量 ≥1
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百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(包括蛋白質、多肽、代謝物)質譜分析以及小分子物質檢測服務。

l 公司采用ISO9001質量控制體系,專業(yè)提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;

l 獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合藥政法規(guī)的藥物質量研究服務;

l 業(yè)務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;

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業(yè)務范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質和小分子代謝物的理化性質分析及結構解析等相關技術服務,為客戶提供高性價比、高效率的技術服務。

價格 詢價

PLS-DA/OPLS-DA二維圖檢測技術服務-詳情介紹:


不同于主成分分析(PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis(PLS-DA)或Orthogonal PLS-DA(OPLS-DA)是一種有監(jiān)督的判別分析統計方法。該方法運用PLS-DA建立代謝物表達量與樣品類別之間的關系模型,來實現對樣品類別的預測。分別建立兩兩分組比較的PLS-DA模型(圖1)或OPLS-DA模型(圖2),模型得到的參數評價會以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分別表示所建模型對X和Y矩陣的解釋率,Q2標示模型的預測能力,理論上R^2、Q^2數值越接近1說明模型越好,越低說明模型的擬合準確性越差,通常情況下,R^2、Q^2高于0.5(50%)較好,高于0.4即可接受,且兩者差值不應過大。臨床樣本由于個tǐ差異大,不可控,尤其大樣本時,R^2、Q^2大小為0.2左右亦可。圖3則是對PLS-DA模型(c)的檢驗,直線的斜率大,Q^2的截距為X,說明PLS-DA模型沒有過擬合。同時通過計算變量投影重要度(Variable Importance for the Projection, VIP)來衡量各代謝物的表達模式對各組樣本分類判別的影響強度和解釋能力,從而輔助標志代謝物的篩選(通常以VIP值>1.0作為篩選標準)(圖4)。

20221219-4328-假手術組和模型組的PLS-DA得分圖.png

圖1 假手術組和模型組的PLS-DA 得分圖


圖2 假手術組和模型組的OPLS-DA模型


圖 3 PLS-DA模型的排列檢驗圖

20221219-5389-PLS-DA模型的排列檢驗圖.png

圖 4 假手術組和模型組的PLS-DA 模型載荷圖

注:紅框所圈的點為VIP>1的代謝產物


PLS-DA/OPLS-DA二維圖檢測技術服務-詳情介紹

百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質譜多組學優(yōu)質服務商

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